RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 NFAT5O94916 1531 aa29.45■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 ABCC6O95255 1503 aa29.45■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 COL18A1P39060 1754 aa29.45■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 NME9Q86XW9 330 aa29.45■■■□□ 2.31
LTB-211ENST00000446745 PDE3BQ13370 1112 aa29.44■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.44■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.42■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.42■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.42■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.41■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.41■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.4■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 BAG6P46379 1132 aa29.4■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.39■■■□□ 2.3
LTB-211ENST00000446745 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 FAM182BQ5T319 152 aa29.38■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 RGPD5Q99666 1765 aa29.38■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 LTN1O94822 1766 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 OVOS2Q6IE36 1432 aa29.36■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 COG3Q96JB2 828 aa29.35■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.33■■■□□ 2.29
LTB-211ENST00000446745 CCDC7Q96M83 1385 aa29.3■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.3■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 DDB1Q16531 1140 aa29.3■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 TRIM37O94972 964 aa29.27■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 DISP2A7MBM2 1401 aa29.27■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 LRRC37A3O60309 1634 aa29.27■■■□□ 2.28
LTB-211ENST00000446745 ERBB3P21860 1342 aa29.26■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.26■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.23■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.22■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 MYOM1P52179 1685 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 APBA3O96018 575 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 IP6K1Q92551 441 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.21■■■□□ 2.27
LTB-211ENST00000446745 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.2■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 EXOC5O00471 708 aa29.19■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 FYB1O15117 783 aa29.19■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 AMPHP49418 695 aa29.19■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.18■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.17■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.17■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 PEAK1Q9H792 1746 aa29.16■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 RTL1A6NKG5 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
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LTB-211ENST00000446745 IL2RBP14784 551 aa29.14■■■□□ 2.26
LTB-211ENST00000446745 TNS2Q63HR2 1409 aa29.13■■■□□ 2.25
LTB-211ENST00000446745 HOXC9P31274 260 aa29.13■■■□□ 2.25
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LTB-211ENST00000446745 BCL9O00512 1426 aa29.11■■■□□ 2.25
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LTB-211ENST00000446745 SBF2Q86WG5 1849 aa29.1■■■□□ 2.25
LTB-211ENST00000446745 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.1■■■□□ 2.25
LTB-211ENST00000446745 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
LTB-211ENST00000446745 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
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LTB-211ENST00000446745 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.07■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 FBLN1P23142 703 aa29.06■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 RREB1Q92766 1687 aa29.05■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.04■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.04■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 FLT4P35916 1363 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 NBPF14Q5TI25 921 aa29.03■■■□□ 2.24
LTB-211ENST00000446745 PLSCR1O15162 318 aa29.01■■■□□ 2.23
LTB-211ENST00000446745 NUP188Q5SRE5 1749 aa29■■■□□ 2.23
LTB-211ENST00000446745 INSRP06213 1382 aa29■■■□□ 2.23
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LTB-211ENST00000446745 NHSQ6T4R5 1651 aa28.96■■■□□ 2.23
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LTB-211ENST00000446745 PANK3Q9H999 370 aa28.95■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 LRP5O75197 1615 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.93■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 NSD2O96028 1365 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 NBPF4Q96M43 638 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.92■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.91■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.91■■■□□ 2.22
LTB-211ENST00000446745 KCNQ2O43526 872 aa28.88■■■□□ 2.21
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