RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		34.12	■■■■□ 3.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		34.12	■■■■□ 3.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COG3	Q96JB2	828 aa		34.11	■■■■□ 3.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	34.11	■■■■□ 3.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		34.08	■■■■□ 3.05
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		34.07	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	COL18A1	P39060	1754 aa		34.07	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		34.04	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM182B	Q5T319	152 aa		34.03	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MYOM1	P52179	1685 aa		34.03	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PANK3	Q9H999	370 aa		34.02	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USP54	Q70EL1	1684 aa		34.02	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		34.02	■■■■□ 3.04
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		34.01	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CRB1	P82279	1406 aa		34	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.99	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.99	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		33.98	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IP6K1	Q92551	441 aa		33.97	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	33.96	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.96	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.95	■■■■□ 3.03
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.94	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EP400	Q96L91	3159 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AMPH	P49418	695 aa		33.92	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RGPD5	Q99666	1765 aa		33.92	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ERBB3	P21860	1342 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HOXC9	P31274	260 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		33.89	■■■■□ 3.02
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.87	■■■■□ 3.01
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ABCC6	O95255	1503 aa		33.85	■■■■□ 3.01
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LTN1	O94822	1766 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.81	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.81	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDB1	Q16531	1140 aa		33.8	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.8	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.79	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.79	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC7	Q96M83	1385 aa		33.79	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		33.79	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.77	■■■■□ 3
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TRIM37	O94972	964 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.75	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EXOC5	O00471	708 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.72	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.71	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IL2RB	P14784	551 aa		33.71	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
ARL6IP4-208	ENST00000439686	INSR	P06213	1382 aa		33.7	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FLT4	P35916	1363 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.68	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PEAK1	Q9H792	1746 aa		33.67	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.65	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NSD2	O96028	1365 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.63	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BAG6	P46379	1132 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	APBA3	O96018	575 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.6	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.58	■■■□□ 2.97
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EYA1	Q99502	592 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KCNQ2	O43526	872 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MEGF6	O75095	1541 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.51	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.5	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BCL9	O00512	1426 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10 ms