RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438146.6

RBFOX2-209, Transcript of RNA binding fox-1 homolog 2, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RBFOX2, Length 1,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBFOX2-209	ENST00000438146	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	COL18A1	P39060	1754 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	USP35	Q9P2H5	1018 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		32.76	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		32.76	■■■□□ 2.84
RBFOX2-209	ENST00000438146	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	LTN1	O94822	1766 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146		A0A0G2JS52	829 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	MYT1	Q01538	1121 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RBFOX2-209	ENST00000438146	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.7	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	AMPH	P49418	695 aa		32.7	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	SOCS7	O14512	581 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	IP6K1	Q92551	441 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	ABCC6	O95255	1503 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	CRB1	P82279	1406 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	HOXC9	P31274	260 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RBFOX2-209	ENST00000438146	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	NSD2	O96028	1365 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	ERBB3	P21860	1342 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	RTL1	A6NKG5	1358 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RBFOX2-209	ENST00000438146	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	FLT4	P35916	1363 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RBFOX2-209	ENST00000438146	INSR	P06213	1382 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RBFOX2-209	ENST00000438146	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RBFOX2-209	ENST00000438146	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RBFOX2-209	ENST00000438146	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RBFOX2-209	ENST00000438146	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RBFOX2-209	ENST00000438146	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.43	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	DISP2	A7MBM2	1401 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	DDB1	Q16531	1140 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RBFOX2-209	ENST00000438146	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	IL2RB	P14784	551 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	MTHFS	P49914	203 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	EP400	Q96L91	3159 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	EXOC5	O00471	708 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RBFOX2-209	ENST00000438146	EYA1	Q99502	592 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	MEGF6	O75095	1541 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RBFOX2-209	ENST00000438146	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	TRIM37	O94972	964 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	IL13	P35225	146 aa		32.21	■■■□□ 2.75
RBFOX2-209	ENST00000438146	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
RBFOX2-209	ENST00000438146	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.16	■■■□□ 2.74

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