RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426660.1

CLUHP2-201, Transcript of clustered mitochondria homolog pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene CLUHP2, Length 1,303 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP2-201ENST00000426660 PPP2R1AP30153 589 aa20.39■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 HOXC9P31274 260 aa20.39■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 IP6K1Q92551 441 aa20.39■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 BTG4Q9NY30 223 aa20.39■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 NWD2Q9ULI1 1742 aa20.38■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 ABCC6O95255 1503 aa20.38■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 MTHFSP49914 203 aa20.37■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 AFF2P51816 1311 aa20.37■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 RTL1A6NKG5 1358 aa20.37■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 NRAPQ86VF7 1730 aa20.37■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.36■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 FLT4P35916 1363 aa20.36■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.36■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.36■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 ANP32CO43423 234 aa20.35■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 USP21Q9UK80 565 aa20.34■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 STRN4Q9NRL3 753 aa20.33■□□□□ 0.85
CLUHP2-201ENST00000426660 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 INSRP06213 1382 aa20.33■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 UNC5CLQ8IV45 518 aa20.32■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 EVA1CP58658 441 aa20.31■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.31■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 ERBB3P21860 1342 aa20.31■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.3■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.28■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.27■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 ATRNO75882 1429 aa20.27■□□□□ 0.84
CLUHP2-201ENST00000426660 VPS72Q15906 364 aa20.27■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 CRB1P82279 1406 aa20.25■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 IL13P35225 146 aa20.25■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.25■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 CFAP53Q96M91 514 aa20.25■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.24■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 CCDC184Q52MB2 194 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 NBPF4Q96M43 638 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 USP35Q9P2H5 1018 aa20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.22■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.22■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 POTEAQ6S8J7 498 aa20.22■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 EYA1Q99502 592 aa20.22■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.22■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 GLI3P10071 1580 aa20.21■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.21■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CLUHP2-201ENST00000426660 MIER1Q8N108 512 aa20.19■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.19■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 NCAPD2Q15021 1401 aa20.17■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.17■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.16■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.16■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 NUDCQ9Y266 331 aa20.15■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CLUHP2-201ENST00000426660 RXRBP28702 533 aa20.14■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.14■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 BARGINQ6ZT62 677 aa20.14■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 MRS2Q9HD23 443 aa20.14■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 HMOX1P09601 288 aa20.13■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 DISP2A7MBM2 1401 aa20.13■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 MEGF6O75095 1541 aa20.12■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 KDRP35968 1356 aa20.11■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.11■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 IL2RBP14784 551 aa20.1■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 CCER2I3L3R5 266 aa20.09■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.08■□□□□ 0.81
CLUHP2-201ENST00000426660 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.07■□□□□ 0.8
CLUHP2-201ENST00000426660 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms