RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 DDX11Q96FC9 970 aa8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 ATP10AO60312 1499 aa8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 HS1BP3Q53T59 392 aa8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ALMS1-201ENST00000423048 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.53□□□□□ -1.04
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ALMS1-201ENST00000423048 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
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ALMS1-201ENST00000423048 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 SMTNL1A8MU46 457 aa8.5□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.5□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 ASXL2Q76L83 1435 aa8.5□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 TXLNAP40222 546 aa8.5□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 POTEB2H3BUK9 544 aa8.49□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 ABCA8O94911 1581 aa8.49□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 RAD50Q92878 1312 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 ATF3P18847 181 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 CREBRFQ8IUR6 639 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.48□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.47□□□□□ -1.05
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ALMS1-201ENST00000423048 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 DISP1Q96F81 1524 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 MYO1BO43795 1136 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 NFKBIBQ15653 356 aa8.47□□□□□ -1.05
ALMS1-201ENST00000423048 FAM107BQ9H098 131 aa8.47□□□□□ -1.05
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