RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418161.1

CCDC13-AS1-201, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 2,049 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CPDO75976 1380 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.17□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PEAK1Q9H792 1746 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NGLY1Q96IV0 654 aa13.16□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HOXC9P31274 260 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BTG4Q9NY30 223 aa13.15□□□□□ -0.3
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FLT4P35916 1363 aa13.14□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IP6K1Q92551 441 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 STRN4Q9NRL3 753 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RGPD5Q99666 1765 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL18A1P39060 1754 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RTL1A6NKG5 1358 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LMO7Q8WWI1 1683 aa13.12□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EVA1CP58658 441 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC184Q52MB2 194 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 INSRP06213 1382 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KIF24Q5T7B8 1368 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AFF2P51816 1311 aa13.11□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CFAP53Q96M91 514 aa13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ERBB3P21860 1342 aa13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLIT2O94813 1529 aa13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 USP21Q9UK80 565 aa13.1□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MRS2Q9HD23 443 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 USP35Q9P2H5 1018 aa13.08□□□□□ -0.31
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ABCC6O95255 1503 aa13.08□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NWD2Q9ULI1 1742 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UNC5CLQ8IV45 518 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NRAPQ86VF7 1730 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IL13P35225 146 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.05□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NBPF4Q96M43 638 aa13.05□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EYA1Q99502 592 aa13.05□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CRB1P82279 1406 aa13.04□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HMOX1P09601 288 aa13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NUDCQ9Y266 331 aa13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCER2I3L3R5 266 aa13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 AEBP1Q8IUX7 1158 aa13.03□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 VPS72Q15906 364 aa13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SULT6B1Q6IMI4 303 aa13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IGSF1Q8N6C5 1336 aa13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa13.01□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RGPD1P0DJD0 1748 aa13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM9BQ8IZU0 186 aa13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ATRNO75882 1429 aa13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 A0A0G2JS52 829 aa12.99□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYT1Q01538 1121 aa12.99□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADAMTS8Q9UP79 889 aa12.99□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GLI3P10071 1580 aa12.98□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 POTEAQ6S8J7 498 aa12.98□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.98□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KDRP35968 1356 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MEGF6O75095 1541 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRKAR2BP31323 418 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC146Q8IYE0 955 aa12.97□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IL2RBP14784 551 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NCAPD2Q15021 1401 aa12.96□□□□□ -0.33
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms