RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL18A1P39060 1754 aa14.27□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGPD5Q99666 1765 aa14.27□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP31Q70CQ4 1352 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SOCS7O14512 581 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GCP02774 474 aa14.26□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.25□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.24□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.24□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VPS72Q15906 364 aa14.23□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STRN4Q9NRL3 753 aa14.22□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCC6O95255 1503 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CAPN15O75808 1086 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.21□□□□□ -0.13
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.21□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.19□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COG3Q96JB2 828 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.18□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0G2JS52 829 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FYB1O15117 783 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EVA1CP58658 441 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYT1Q01538 1121 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP35Q9P2H5 1018 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.16□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRB1P82279 1406 aa14.15□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PEAK1Q9H792 1746 aa14.15□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EP400Q96L91 3159 aa14.15□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRC37A3O60309 1634 aa14.15□□□□□ -0.14
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC7Q96M83 1385 aa14.14□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.14□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PANK3Q9H999 370 aa14.14□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FBLN1P23142 703 aa14.13□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.13□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.13□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.13□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.12□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.12□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.11□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.11□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERBB3P21860 1342 aa14.11□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RTL1A6NKG5 1358 aa14.1□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.1□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HOXC9P31274 260 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AMPHP49418 695 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BARGINQ6ZT62 677 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NSD2O96028 1365 aa14.08□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DISP2A7MBM2 1401 aa14.07□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IP6K1Q92551 441 aa14.07□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM182BQ5T319 152 aa14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FLT4P35916 1363 aa14.06□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.05□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.05□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.04□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNS2Q63HR2 1409 aa14.04□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCB7O75027 752 aa14.03□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 INSRP06213 1382 aa14.03□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.03□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.02□□□□□ -0.16
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.02□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MORC1Q86VD1 984 aa14.01□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SBF2Q86WG5 1849 aa14.01□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MEGF6O75095 1541 aa14□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDE3BQ13370 1112 aa14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms