RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRB1P82279 1406 aa11.87□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COG3Q96JB2 828 aa11.87□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EVA1CP58658 441 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHRNA2Q15822 529 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BARGINQ6ZT62 677 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTL1A6NKG5 1358 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa11.86□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSD2O96028 1365 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NME9Q86XW9 330 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CGNL1Q0VF96 1302 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.85□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC125Q86Z20 511 aa11.84□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.84□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC7Q96M83 1385 aa11.83□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD5Q99666 1765 aa11.83□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EP400Q96L91 3159 aa11.83□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCP11L2Q8N4U5 519 aa11.83□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STRN4Q9NRL3 753 aa11.83□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FYB1O15117 783 aa11.82□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.82□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERBB3P21860 1342 aa11.82□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.81□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0G2JS52 829 aa11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYT1Q01538 1121 aa11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IP6K1Q92551 441 aa11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.8□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOX12O15370 315 aa11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLT4P35916 1363 aa11.79□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC37A3O60309 1634 aa11.78□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.78□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.78□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.78□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.78□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DISP2A7MBM2 1401 aa11.77□□□□□ -0.52
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMPHP49418 695 aa11.77□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.77□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGNBP2Q9H3C7 697 aa11.77□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.77□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL9O00512 1426 aa11.77□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXC9P31274 260 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE3BQ13370 1112 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP35Q9P2H5 1018 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INSRP06213 1382 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNS2Q63HR2 1409 aa11.76□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.75□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PANK3Q9H999 370 aa11.75□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa11.75□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF39Q9H2S5 420 aa11.74□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PEAK1Q9H792 1746 aa11.74□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDB1Q16531 1140 aa11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.73□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL2RBP14784 551 aa11.72□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.71□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAG6P46379 1132 aa11.71□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCAPD2Q15021 1401 aa11.7□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SBF2Q86WG5 1849 aa11.7□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOC5O00471 708 aa11.7□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MORC1Q86VD1 984 aa11.69□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD2P0DJD1 1756 aa11.68□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NHSQ6T4R5 1651 aa11.68□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLKQ9UBT6 870 aa11.67□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.67□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.66□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.66□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.66□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RREB1Q92766 1687 aa11.65□□□□□ -0.54
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