RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 NLRP6P59044 892 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 CABP2Q9NPB3 220 aa28.16■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 COL18A1P39060 1754 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 SLIT3O75094 1523 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.14■■■□□ 2.1
HOXD12-201ENST00000404162 TXNRD1Q16881 649 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 SYT17Q9BSW7 474 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 STK32BQ9NY57 414 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP12Q02952 1782 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 BCL9O00512 1426 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 USP6P35125 1406 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 SLC15A2Q16348 729 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 CABP1Q9NZU7 370 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 UTRNP46939 3433 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
HOXD12-201ENST00000404162 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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HOXD12-201ENST00000404162 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3C2AO00443 1686 aa28.06■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 MTFR1LQ9H019 292 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 CHD4Q14839 1912 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
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HOXD12-201ENST00000404162 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.03■■■□□ 2.08
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HOXD12-201ENST00000404162 C1QTNF8P60827 252 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD12-201ENST00000404162 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.01■■■□□ 2.07
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HOXD12-201ENST00000404162 SOX12O15370 315 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXD12-201ENST00000404162 ARXQ96QS3 562 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD12-201ENST00000404162 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXD12-201ENST00000404162 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXD12-201ENST00000404162 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 NHSQ6T4R5 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 TNS2Q63HR2 1409 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC7Q96M83 1385 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 PAPPAQ13219 1627 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K5Q99683 1374 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF827Q17R98 1081 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
HOXD12-201ENST00000404162 NFAT5O94916 1531 aa27.88■■■□□ 2.05
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HOXD12-201ENST00000404162 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.85■■■□□ 2.05
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HOXD12-201ENST00000404162 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXD12-201ENST00000404162 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
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HOXD12-201ENST00000404162 AKT1S1Q96B36 256 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD12-201ENST00000404162 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD12-201ENST00000404162 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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HOXD12-201ENST00000404162 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.74■■■□□ 2.03
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HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 POLD1P28340 1107 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 USP31Q70CQ4 1352 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 LTN1O94822 1766 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD12-201ENST00000404162 KCNQ4P56696 695 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.7■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 NME9Q86XW9 330 aa27.7■■■□□ 2.02
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HOXD12-201ENST00000404162 USP54Q70EL1 1684 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.67■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.64■■■□□ 2.02
HOXD12-201ENST00000404162 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 CEP350Q5VT06 3117 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 GRIN3BO60391 1043 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 LY75O60449 1722 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
HOXD12-201ENST00000404162 NSD2O96028 1365 aa27.57■■■□□ 2
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.57■■■□□ 2
HOXD12-201ENST00000404162 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.56■■■□□ 2
HOXD12-201ENST00000404162 TMC1Q8TDI8 760 aa27.56■■■□□ 2
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