RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 CEP63Q96MT8 703 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PDILTQ8N807 584 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 PPM1EQ8WY54 764 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF214Q8ND24 703 aa6.56□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 CCDC181Q5TID7 509 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 PTPN14Q15678 1187 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH1P12882 1939 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 MYH4Q9Y623 1939 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 KINO60870 393 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADGRL1O94910 1474 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRZ1-201ENST00000393386 HSPA4P34932 840 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A1B0GUL7 405 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 MCM2P49736 904 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 VGLL3A8MV65 326 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 HECW1Q76N89 1606 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRZ1-201ENST00000393386 CACNA1FO60840 1977 aa6.53□□□□□ -1.36
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