RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDK19Q9BWU1 502 aa8.07□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 EVA1CP58658 441 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBPF14Q5TI25 921 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFAT5O94916 1531 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABTB2Q8N961 1025 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCP02774 474 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYT17Q9BSW7 474 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP6P35125 1406 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 LY75O60449 1722 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLSCR1O15162 318 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 C1QTNF8P60827 252 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF827Q17R98 1081 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
RNU6-171P-201ENST00000384354 USP54Q70EL1 1684 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDB1Q16531 1140 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNRD1Q16881 649 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABP2Q9NPB3 220 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC6O95255 1503 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCL9O00512 1426 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNS2Q63HR2 1409 aa8.02□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC15A2Q16348 729 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.01□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 SOX12O15370 315 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACSBG1Q96GR2 724 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC4BQ9NT99 713 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNQ4P56696 695 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLRP6P59044 892 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFFO2Q5TF58 517 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLRP13Q86W25 1043 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.99□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTFR1LQ9H019 292 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK32BQ9NY57 414 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 CABP1Q9NZU7 370 aa7.98□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K5Q99683 1374 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 DCAF8L1A6NGE4 600 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF25Q86VW2 580 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARXQ96QS3 562 aa7.97□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 C5P01031 1676 aa7.96□□□□□ -1.13
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLHL34Q8N239 644 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGB4P16144 1822 aa7.96□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 NSD2O96028 1365 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.95□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 AKT1S1Q96B36 256 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP10DQ9P241 1426 aa7.94□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR162Q16538 588 aa7.93□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCNTO95613 3336 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERBB3P21860 1342 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC7Q96M83 1385 aa7.92□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC5O00471 708 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 MSL1Q68DK7 614 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 NME9Q86XW9 330 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADCY9O60503 1353 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 MEGF6O75095 1541 aa7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMIM5Q71RC9 77 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.9□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4BP0C0L5 1744 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-171P-201ENST00000384354 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBLN1P23142 703 aa7.89□□□□□ -1.15
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms