RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TTLL8A6PVC2 850 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CBLBQ13191 982 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTSQ03393 145 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NR6A1Q15406 480 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SH3D19Q5HYK7 790 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PDXDC2PQ6P474 469 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZBTB33Q86T24 672 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SPINT1O43278 529 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 Q6ZVU0 165 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AGBL1Q96MI9 1066 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AP1G2O75843 785 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RAB15P59190 212 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RELBQ01201 579 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRT76Q01546 638 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAM32Q8TC27 787 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KDM4CQ9H3R0 1056 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTK2Q05397 1052 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DDRGK1Q96HY6 314 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM117AQ9C073 453 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 USP17L8P0C7I0 530 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNFT1Q5M7Z0 435 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PPP2R2DQ66LE6 453 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EPS8L1Q8TE68 723 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GPSM3Q9Y4H4 160 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CDC14CA4D256 554 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ITGA6P23229 1130 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PNMA1Q8ND90 353 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF217Q8TC41 542 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLC35F4A4IF30 521 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADH1AP07327 375 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SVOPQ8N4V2 548 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LILRA1O75019 489 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RFC5P40937 340 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GSK3AP49840 483 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNMA1Q12791 1236 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCTD17Q8N5Z5 321 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CYLDQ9NQC7 956 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ESPNB1AK53 854 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADD1P35611 737 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTGIRP43119 386 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SV2AQ7L0J3 742 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 WHAMMQ8TF30 809 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SLURP2P0DP57 97 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RASSF7Q02833 373 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRIM34Q9BYJ4 488 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GDF11O95390 407 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RHOQP17081 205 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAMTS2O95450 1211 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GAS6Q14393 721 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZBBXA8MT70 800 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MEN1O00255 615 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms