RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 USP54Q70EL1 1684 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 CRB1P82279 1406 aa22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 EP400Q96L91 3159 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 ABCC6O95255 1503 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-201ENST00000344376 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 COL18A1P39060 1754 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 COG3Q96JB2 828 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 PDE3BQ13370 1112 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4B-201ENST00000344376 FAM182BQ5T319 152 aa22.33■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 BAG6P46379 1132 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC7Q96M83 1385 aa22.29■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 LTN1O94822 1766 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 ERBB3P21860 1342 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 MYOM1P52179 1685 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 RGPD5Q99666 1765 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 FYB1O15117 783 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 DDB1Q16531 1140 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-201ENST00000344376 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.26■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 IP6K1Q92551 441 aa22.25■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 AMPHP49418 695 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC37A3O60309 1634 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 TRIM37O94972 964 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 DISP2A7MBM2 1401 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 RTL1A6NKG5 1358 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-201ENST00000344376 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 HOXC9P31274 260 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 EXOC5O00471 708 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 IL2RBP14784 551 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 FBLN1P23142 703 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 APBA3O96018 575 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 TNS2Q63HR2 1409 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-201ENST00000344376 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 PEAK1Q9H792 1746 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 FLT4P35916 1363 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 BCL9O00512 1426 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 PANK3Q9H999 370 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 INSRP06213 1382 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-201ENST00000344376 NSD2O96028 1365 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 NBPF4Q96M43 638 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 SBF2Q86WG5 1849 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 PLSCR1O15162 318 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.02■■□□□ 1.12
ATG4B-201ENST00000344376 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.01■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 RREB1Q92766 1687 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 MEGF6O75095 1541 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 NBPF14Q5TI25 921 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 POLKQ9UBT6 870 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-201ENST00000344376 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.99■■□□□ 1.11
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