RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 SHPRHQ149N8 1683 aa25.67■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 CPDO75976 1380 aa25.66■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 KIAA0232Q92628 1395 aa25.65■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 LTN1O94822 1766 aa25.65■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SYTL1-201ENST00000318074 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.64■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.63■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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SYTL1-201ENST00000318074 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.62■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 FCHSD2O94868 740 aa25.61■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 HMOX1P09601 288 aa25.6■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 RUNDC1Q96C34 613 aa25.59■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.58■■□□□ 1.69
SYTL1-201ENST00000318074 JCADQ9P266 1359 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 EYA1Q99502 592 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 NEFMP07197 916 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 HSPA1LP34931 641 aa25.57■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 ABCA3Q99758 1704 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 APAF1O14727 1248 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 PRKAR2BP31323 418 aa25.55■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 ABCC6O95255 1503 aa25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 ERBB3P21860 1342 aa25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 FAM83GA6ND36 823 aa25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.54■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.53■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.52■■□□□ 1.68
SYTL1-201ENST00000318074 ADAMTS2O95450 1211 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 NBPF4Q96M43 638 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.51■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 COL18A1P39060 1754 aa25.49■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 KDRP35968 1356 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.48■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 EVA1CP58658 441 aa25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 NGEFQ8N5V2 710 aa25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 BTG4Q9NY30 223 aa25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.47■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 NEUROD2Q15784 382 aa25.46■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.45■■□□□ 1.67
SYTL1-201ENST00000318074 STRN4Q9NRL3 753 aa25.45■■□□□ 1.66
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SYTL1-201ENST00000318074 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.44■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 RGPD5Q99666 1765 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 RIPK4P57078 832 aa25.39■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYTL1-201ENST00000318074 NFE2L2Q16236 605 aa25.39■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 NCAPD2Q15021 1401 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 CCDC27Q2M243 656 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 WWC1Q8IX03 1113 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 NGLY1Q96IV0 654 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 C8orf37Q96NL8 207 aa25.36■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.35■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.35■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 PDE3BQ13370 1112 aa25.34■■□□□ 1.65
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SYTL1-201ENST00000318074 ZNF521Q96K83 1311 aa25.33■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 CRB1P82279 1406 aa25.33■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SYTL1-201ENST00000318074 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 FBXO41Q8TF61 875 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 USP35Q9P2H5 1018 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 GOLGA2Q08379 1002 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 LRP6O75581 1613 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 SLIT2O94813 1529 aa25.3■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 WDR63Q8IWG1 891 aa25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-201ENST00000318074 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.28■■□□□ 1.64
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