RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301323.7

RECQL4-201, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-201ENST00000301323 MYOM1P52179 1685 aa23.1■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 BARGINQ6ZT62 677 aa23.1■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 LTN1O94822 1766 aa23.09■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.09■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 USP35Q9P2H5 1018 aa23.09■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.08■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 TMF1P82094 1093 aa23.08■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.08■■□□□ 1.29
RECQL4-201ENST00000301323 LRRC37A3O60309 1634 aa23.08■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 SOX12O15370 315 aa23.07■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.07■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.07■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.05■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 FAM182BQ5T319 152 aa23.04■■□□□ 1.28
RECQL4-201ENST00000301323 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.01■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 PEAK1Q9H792 1746 aa23.01■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 DISP2A7MBM2 1401 aa22.99■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.99■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 CDCA8Q53HL2 280 aa22.99■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.99■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.98■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 ERBB3P21860 1342 aa22.96■■□□□ 1.27
RECQL4-201ENST00000301323 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.95■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.95■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 PDE3BQ13370 1112 aa22.94■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 CCDC7Q96M83 1385 aa22.93■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.92■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.92■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 BAG6P46379 1132 aa22.92■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 COG3Q96JB2 828 aa22.92■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.91■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 TNS2Q63HR2 1409 aa22.9■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 SBF2Q86WG5 1849 aa22.89■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.89■■□□□ 1.26
RECQL4-201ENST00000301323 FYB1O15117 783 aa22.89■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 RREB1Q92766 1687 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 TRIM37O94972 964 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 DDB1Q16531 1140 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 RTL1A6NKG5 1358 aa22.88■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 IP6K1Q92551 441 aa22.87■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.87■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 BCL9O00512 1426 aa22.86■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.85■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 FBLN1P23142 703 aa22.84■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.84■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.84■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.83■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 HOXC9P31274 260 aa22.83■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.83■■□□□ 1.25
RECQL4-201ENST00000301323 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.81■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.81■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 APBA3O96018 575 aa22.8■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 NHSQ6T4R5 1651 aa22.78■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 IL2RBP14784 551 aa22.78■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 AMPHP49418 695 aa22.78■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.77■■□□□ 1.24
RECQL4-201ENST00000301323 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.77■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 EXOC5O00471 708 aa22.76■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.76■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 FLT4P35916 1363 aa22.76■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 LRP5O75197 1615 aa22.75■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.75■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 INSRP06213 1382 aa22.75■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 MEGF6O75095 1541 aa22.74■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.74■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RECQL4-201ENST00000301323 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.7■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.69■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 NCAPD2Q15021 1401 aa22.68■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.68■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 NBPF4Q96M43 638 aa22.68■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 BTAF1O14981 1849 aa22.67■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 PLSCR1O15162 318 aa22.67■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 PANK3Q9H999 370 aa22.67■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 NSD2O96028 1365 aa22.66■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.66■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.66■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.65■■□□□ 1.22
RECQL4-201ENST00000301323 KCNQ2O43526 872 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms