RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 KIAA0232Q92628 1395 aa33.53■■■□□ 2.96
NTN3-201ENST00000293973 IL13P35225 146 aa33.51■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 ADAMTS8Q9UP79 889 aa33.51■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 HSPA1LP34931 641 aa33.49■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP33.49■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 JCADQ9P266 1359 aa33.49■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 COL18A1P39060 1754 aa33.49■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 ABCC6O95255 1503 aa33.48■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 RGPD5Q99666 1765 aa33.47■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.47■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.45■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 CHRNA2Q15822 529 aa33.45■■■□□ 2.95
NTN3-201ENST00000293973 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.44■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 FBXO41Q8TF61 875 aa33.43■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 RGPD1P0DJD0 1748 aa33.42■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.4■■■□□ 2.94
NTN3-201ENST00000293973 FAM83GA6ND36 823 aa33.36■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.36■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 ERBB3P21860 1342 aa33.35■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.35■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 EYA1Q99502 592 aa33.34■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.34■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.33■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.33■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 ADAMTS2O95450 1211 aa33.33■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 HMOX1P09601 288 aa33.33■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.33■■■□□ 2.93
NTN3-201ENST00000293973 FCHSD2O94868 740 aa33.32■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP33.31■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.3■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.3■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 AEBP1Q8IUX7 1158 aa33.29■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 RUNDC1Q96C34 613 aa33.28■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.27■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 NBPF4Q96M43 638 aa33.27■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 KDRP35968 1356 aa33.27■■■□□ 2.92
NTN3-201ENST00000293973 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.26■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 PRKAR2BP31323 418 aa33.26■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.26■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.26■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 BTG4Q9NY30 223 aa33.25■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 LRP6O75581 1613 aa33.24■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa33.23■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.23■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.22■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 NCAPD2Q15021 1401 aa33.22■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.21■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.21■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 APAF1O14727 1248 aa33.2■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 EVA1CP58658 441 aa33.2■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 STRN4Q9NRL3 753 aa33.2■■■□□ 2.91
NTN3-201ENST00000293973 NEFMP07197 916 aa33.19■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.19■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.18■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 NRAPQ86VF7 1730 aa33.16■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa33.16■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.16■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 SLIT2O94813 1529 aa33.16■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 C8orf37Q96NL8 207 aa33.15■■■□□ 2.9
NTN3-201ENST00000293973 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP33.13■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 ZBED9Q6R2W3 1325 aa33.13■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 CRB1P82279 1406 aa33.12■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 NGLY1Q96IV0 654 aa33.12■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.1■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 TMPOP42166 694 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 NEUROD2Q15784 382 aa33.09■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 NGEFQ8N5V2 710 aa33.08■■■□□ 2.89
NTN3-201ENST00000293973 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 NFE2L2Q16236 605 aa33.06■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.05■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 DLG5Q8TDM6 1919 aa33.05■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.04■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.03■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 MEGF6O75095 1541 aa33.03■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 RIPK4P57078 832 aa33.02■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 USP35Q9P2H5 1018 aa33.02■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.88
NTN3-201ENST00000293973 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.01■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 TATP17735 454 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 CCDC27Q2M243 656 aa33■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa32.99■■■□□ 2.87
NTN3-201ENST00000293973 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms