RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 STRN4Q9NRL3 753 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 USP35Q9P2H5 1018 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 SLIT3O75094 1523 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 HOXC9P31274 260 aa14.64□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.63□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 RGPD5Q99666 1765 aa14.63□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 BTG4Q9NY30 223 aa14.63□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.62□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 AATKQ6ZMQ8 1374 aa14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 HMOX1P09601 288 aa14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 NGLY1Q96IV0 654 aa14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 SHPRHQ149N8 1683 aa14.6□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 USP54Q70EL1 1684 aa14.59□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.59□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 FLT4P35916 1363 aa14.58□□□□□ -0.07
TTPA-201ENST00000260116 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 IP6K1Q92551 441 aa14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 ANKRD24Q8TF21 1146 aa14.58□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.57□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.57□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 NBPF4Q96M43 638 aa14.57□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 ERBB3P21860 1342 aa14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.56□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 IL13P35225 146 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 EYA1Q99502 592 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 CPDO75976 1380 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 EVA1CP58658 441 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 COL18A1P39060 1754 aa14.55□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.54□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 CFAP53Q96M91 514 aa14.54□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.53□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 INSRP06213 1382 aa14.53□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 AFF2P51816 1311 aa14.53□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 USP21Q9UK80 565 aa14.52□□□□□ -0.08
TTPA-201ENST00000260116 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.52□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.51□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 BCL9LQ86UU0 1499 aa14.51□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.51□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 CCER2I3L3R5 266 aa14.5□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 RTL1A6NKG5 1358 aa14.5□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 NEUROD2Q15784 382 aa14.49□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.49□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.49□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 SLIT2O94813 1529 aa14.48□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 PRKAR2BP31323 418 aa14.48□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 UNC5CLQ8IV45 518 aa14.48□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 A0A0G2JS52 829 aa14.47□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 NUDCQ9Y266 331 aa14.47□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.46□□□□□ -0.09
TTPA-201ENST00000260116 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.46□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.45□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 FAM182BQ5T319 152 aa14.45□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 NRAPQ86VF7 1730 aa14.44□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 MEGF6O75095 1541 aa14.44□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 CRB1P82279 1406 aa14.44□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 APAF1O14727 1248 aa14.43□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.43□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.42□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.42□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 POTEAQ6S8J7 498 aa14.42□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 DCTN1Q14203 1278 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
TTPA-201ENST00000260116 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms