RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 CHRNA2Q15822 529 aa21.25■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.25■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 RTL1A6NKG5 1358 aa21.24■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 MTHFSP49914 203 aa21.23■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 FLT4P35916 1363 aa21.23■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 NRAPQ86VF7 1730 aa21.22■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 AMPHP49418 695 aa21.22■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 HOXC9P31274 260 aa21.21■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.21■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.21■□□□□ 0.99
CCL25-201ENST00000253451 FAM83GA6ND36 823 aa21.2■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 MIER1Q8N108 512 aa21.2■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.2■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 IP6K1Q92551 441 aa21.18■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.18■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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CCL25-201ENST00000253451 C8orf37Q96NL8 207 aa21.17■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 INSRP06213 1382 aa21.17■□□□□ 0.98
CCL25-201ENST00000253451 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
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CCL25-201ENST00000253451 SLIT2O94813 1529 aa21.16■□□□□ 0.98
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CCL25-201ENST00000253451 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.12■□□□□ 0.97
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CCL25-201ENST00000253451 ERBB3P21860 1342 aa21.11■□□□□ 0.97
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CCL25-201ENST00000253451 MRS2Q9HD23 443 aa21.1■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 AFF2P51816 1311 aa21.09■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.09■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 STRN4Q9NRL3 753 aa21.09■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 IL13P35225 146 aa21.08■□□□□ 0.97
CCL25-201ENST00000253451 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.07■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 CCER2I3L3R5 266 aa21.07■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.06■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
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CCL25-201ENST00000253451 USP21Q9UK80 565 aa21.05■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.05■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 CRB1P82279 1406 aa21.04■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.04■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
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CCL25-201ENST00000253451 NBPF4Q96M43 638 aa21.03■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 EYA1Q99502 592 aa21.03■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.03■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 NCAPD2Q15021 1401 aa21.03■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.03■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.02■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 ATRNO75882 1429 aa21.02■□□□□ 0.96
CCL25-201ENST00000253451 NUDCQ9Y266 331 aa21.01■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 GLI3P10071 1580 aa21■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 HMOX1P09601 288 aa20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.98■□□□□ 0.95
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CCL25-201ENST00000253451 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.98■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.97■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 USP35Q9P2H5 1018 aa20.97■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.97■□□□□ 0.95
CCL25-201ENST00000253451 KDRP35968 1356 aa20.97■□□□□ 0.95
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CCL25-201ENST00000253451 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.94■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 DISP2A7MBM2 1401 aa20.94■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.93■□□□□ 0.94
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CCL25-201ENST00000253451 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.93■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.92■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.92■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 LRRC37A3O60309 1634 aa20.92■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 PRKAR2BP31323 418 aa20.91■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.91■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.9■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CCL25-201ENST00000253451 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.89■□□□□ 0.93
CCL25-201ENST00000253451 FCHSD2O94868 740 aa20.88■□□□□ 0.93
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