RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.02■■□□□ 1.44
HOXC6-201ENST00000243108 BARGINQ6ZT62 677 aa24.01■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 USP31Q70CQ4 1352 aa24■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 CRB1P82279 1406 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 LTN1O94822 1766 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXC6-201ENST00000243108 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC7Q96M83 1385 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 SLC24A1O60721 1099 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 TMF1P82094 1093 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC6O95255 1503 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 LRRC37A3O60309 1634 aa23.89■■□□□ 1.42
HOXC6-201ENST00000243108 PDE3BQ13370 1112 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 MYOM1P52179 1685 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM37O94972 964 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 PEAK1Q9H792 1746 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 BAG6P46379 1132 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 FBLN1P23142 703 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 DISP2A7MBM2 1401 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXC6-201ENST00000243108 SBF2Q86WG5 1849 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 ERBB3P21860 1342 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 ANP32CO43423 234 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 FYB1O15117 783 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 DDB1Q16531 1140 aa23.8■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 CDCA8Q53HL2 280 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 COG3Q96JB2 828 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.79■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 CCER2I3L3R5 266 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.78■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXC6-201ENST00000243108 APBA3O96018 575 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 IP6K1Q92551 441 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.76■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 RREB1Q92766 1687 aa23.74■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 HOXC9P31274 260 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.7■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
HOXC6-201ENST00000243108 TNS2Q63HR2 1409 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 EXOC5O00471 708 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 BCL9O00512 1426 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 IL2RBP14784 551 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 AMPHP49418 695 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.64■■□□□ 1.38
HOXC6-201ENST00000243108 RTL1A6NKG5 1358 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 KCNQ2O43526 872 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 NHSQ6T4R5 1651 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 PLSCR1O15162 318 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 PROM2Q8N271 834 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF4Q96M43 638 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 LRP5O75197 1615 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXC6-201ENST00000243108 MEGF6O75095 1541 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms