RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 PDE3BQ13370 1112 aa27.47■■□□□ 1.99
C20orf27-201ENST00000217195 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.47■■□□□ 1.99
C20orf27-201ENST00000217195 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
C20orf27-201ENST00000217195 USP54Q70EL1 1684 aa27.47■■□□□ 1.99
C20orf27-201ENST00000217195 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.45■■□□□ 1.99
C20orf27-201ENST00000217195 NFAT5O94916 1531 aa27.45■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.43■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 COL18A1P39060 1754 aa27.42■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.42■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 SOX12O15370 315 aa27.41■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 NME9Q86XW9 330 aa27.41■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.4■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.4■■□□□ 1.98
C20orf27-201ENST00000217195 DISP2A7MBM2 1401 aa27.39■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.39■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.39■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.38■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa27.37■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 OVOS2Q6IE36 1432 aa27.37■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC7Q96M83 1385 aa27.36■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 FAM182BQ5T319 152 aa27.35■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 DDB1Q16531 1140 aa27.34■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 COG3Q96JB2 828 aa27.34■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.33■■□□□ 1.97
C20orf27-201ENST00000217195 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.32■■□□□ 1.96
C20orf27-201ENST00000217195 ERBB3P21860 1342 aa27.31■■□□□ 1.96
C20orf27-201ENST00000217195 TRIM37O94972 964 aa27.3■■□□□ 1.96
C20orf27-201ENST00000217195 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
C20orf27-201ENST00000217195 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
C20orf27-201ENST00000217195 LRRC37A3O60309 1634 aa27.26■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 LTN1O94822 1766 aa27.25■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 APBA3O96018 575 aa27.25■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.25■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.24■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 IP6K1Q92551 441 aa27.24■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 BCL9O00512 1426 aa27.24■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 RGPD5Q99666 1765 aa27.24■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 EXOC5O00471 708 aa27.23■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.23■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.23■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.958e-7■■■■■ 28.7
C20orf27-201ENST00000217195 RTL1A6NKG5 1358 aa27.21■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.2■■□□□ 1.95
C20orf27-201ENST00000217195 FYB1O15117 783 aa27.19■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 TNS2Q63HR2 1409 aa27.19■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 IL2RBP14784 551 aa27.18■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 AMPHP49418 695 aa27.18■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 PEAK1Q9H792 1746 aa27.18■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.18■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.15■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 HOXC9P31274 260 aa27.15■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.15■■□□□ 1.94
C20orf27-201ENST00000217195 PLSCR1O15162 318 aa27.14■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 MYOM1P52179 1685 aa27.12■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.12■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF14Q5TI25 921 aa27.12■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.11■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.1■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.1■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 RREB1Q92766 1687 aa27.08■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.08■■□□□ 1.93
C20orf27-201ENST00000217195 SBF2Q86WG5 1849 aa27.07■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 FLT4P35916 1363 aa27.06■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 INSRP06213 1382 aa27.05■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 LRP5O75197 1615 aa27.04■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.04■■□□□ 1.92
C20orf27-201ENST00000217195 FBLN1P23142 703 aa27.01■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.01■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 NHSQ6T4R5 1651 aa26.98■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 NSD2O96028 1365 aa26.97■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.97■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.95■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.94■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 NBPF4Q96M43 638 aa26.94■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.92■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 PANK3Q9H999 370 aa26.92■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.92■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 KCNQ2O43526 872 aa26.91■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 TXNRD1Q16881 649 aa26.91■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.91■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.9■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 MEGF6O75095 1541 aa26.9■■□□□ 1.9
C20orf27-201ENST00000217195 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms