RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 FIBPO43427 364 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NEMFO60524 1076 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ARHGEF11O15085 1522 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 MICALL1Q8N3F8 863 aa13.44□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 EZRP15311 586 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 UVSSAQ2YD98 709 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 FILIP1LQ4L180 1135 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC7Q96M83 1385 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NUTM2FA1L443 756 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 RSPH14Q9UHP6 348 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 CASQ1P31415 396 aa13.43□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 TRIM29Q14134 588 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 PANK2Q9BZ23 570 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 GOLIM4O00461 696 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 SERPINC1P01008 464 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ROCK1Q13464 1354 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ZSCAN12O43309 604 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 DMTNQ08495 405 aa13.42□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 CEP135Q66GS9 1140 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 DRC1Q96MC2 740 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 MRVI1Q9Y6F6 885 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 PDCP20941 246 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC183Q5T5S1 534 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 PANK1Q8TE04 598 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 LRCH2Q5VUJ6 765 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.41□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 IGSF3O75054 1194 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC181Q5TID7 509 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 A0A1B0GUA9 196 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 WDR66Q8TBY9 1149 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NUP62CLQ9H1M0 184 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
ZBED4-201ENST00000216268 NEK4P51957 841 aa13.4□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 URI1O94763 535 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 HECW1Q76N89 1606 aa13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.39□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PDE3AQ14432 1141 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC171Q6TFL3 1326 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 LMOD2Q6P5Q4 547 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ADCY5O95622 1261 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 USP25Q9UHP3 1055 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 V9GYY5 206 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 MAP3K11Q16584 847 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 APAF1O14727 1248 aa13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 HSPA4P34932 840 aa13.37□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 UACAQ9BZF9 1416 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 MAP2K2P36507 400 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 KRT85P78386 507 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SCAPERQ9BY12 1400 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CFAP45Q9UL16 551 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.36□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PPM1EQ8WY54 764 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PANK3Q9H999 370 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CPLX1O14810 134 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 CAPN2P17655 700 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 USP47Q96K76 1375 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 PSMA5P28066 241 aa13.35□□□□□ -0.27
ZBED4-201ENST00000216268 SWAP70Q9UH65 585 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms