RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP6P35125 1406 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CASZ1Q86V15 1759 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SBF2Q86WG5 1849 aa27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLIT3O75094 1523 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PROM2Q8N271 834 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CABP1Q9NZU7 370 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STK32BQ9NY57 414 aa27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PTGER2P43116 358 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BCL9O00512 1426 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TONSLQ96HA7 1378 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.98■■□□□ 1.91
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC15A2Q16348 729 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SOX12O15370 315 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PIK3C2AO00443 1686 aa26.93■■□□□ 1.9
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYT17Q9BSW7 474 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 AKAP12Q02952 1782 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 MTFR1LQ9H019 292 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EVC2Q86UK5 1308 aa26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CCDC7Q96M83 1385 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.83■■□□□ 1.89
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ARXQ96QS3 562 aa26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC6A-201ENST00000006275 RGPD5Q99666 1765 aa26.83■■□□□ 1.89
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 C1QTNF8P60827 252 aa26.78■■□□□ 1.88
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GPR162Q16538 588 aa26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PAPPAQ13219 1627 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ERBB3P21860 1342 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 IL2RBP14784 551 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ZNF827Q17R98 1081 aa26.73■■□□□ 1.87
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 BTAF1O14981 1849 aa26.67■■□□□ 1.86
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP31Q70CQ4 1352 aa26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 POLD1P28340 1107 aa26.66■■□□□ 1.86
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 NME9Q86XW9 330 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.62■■□□□ 1.85
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TMC1Q8TDI8 760 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LTN1O94822 1766 aa26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC6A-201ENST00000006275 USP54Q70EL1 1684 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KCNQ4P56696 695 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.51■■□□□ 1.83
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