RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000119797.7

Rabgef1-203, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,690 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cntnap1O54991 1385 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rtl5Q5DTT4 599 aa15.82■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slx1bQ8BX32 270 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 PalmQ9Z0P4 383 aa15.81■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pard3Q99NH2 1333 aa15.8■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CrklP47941 303 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MpripP97434 1024 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Eya1P97767 591 aa15.79■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Lrp6O88572 1613 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 OptnQ8K3K8 584 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Emilin2Q8K482 1074 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 MypopQ8R4U1 393 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Spef2Q8C9J3 1734 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Esx1O88933 382 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 RgmbQ7TQ33 436 aa15.78■□□□□ 0.12
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zfp777B9EKF4 885 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cypt2Q6P924 180 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 FocadA2AKG8 1798 aa15.77■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kdm6aO70546 1401 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Slit1Q80TR4 1531 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Col15a1O35206 1367 aa15.76■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TkfcQ8VC30 578 aa15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fchsd2Q3USJ8 740 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Golga2Q921M4 999 aa15.74■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mcm10Q0VBD2 885 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Psrc1Q9D0P7 329 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zeb2Q9R0G7 1215 aa15.72■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plekhd1B2RPU2 505 aa15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TnikP83510 1323 aa15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pak3Q61036 559 aa15.71■□□□□ 0.11
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Shank2Q80Z38 1476 aa15.71■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Apaf1O88879 1249 aa15.71■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Plin1Q8CGN5 517 aa15.71■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gm10471E9Q1C7 252 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zranb3Q6NZP1 1069 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Eno4Q8C042 619 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa15.7■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Simc1E9Q6E9 1354 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Usp19Q3UJD6 1360 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 InhbeO08717 350 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Zpr1Q62384 459 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Q4VA45 678 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa15.69■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Stk31Q99MW1 1018 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Uspl1Q3ULM6 1089 aa15.68■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Akap11E9Q777 1895 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Znf541Q0GGX2 1363 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ccdc129Q14B48 1034 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Aplp2Q06335 707 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fer1l6E0CZ42 1862 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Kat6bQ8BRB7 1872 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 HypkQ9CR41 129 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Iqcf3Q9D498 203 aa15.66■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cacna1sQ02789 1880 aa15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Stra8P70278 393 aa15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cabp2Q9JLK4 216 aa15.65■□□□□ 0.1
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Arfgef2A2A5R2 1792 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Pm20d1Q8C165 503 aa15.64■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dmrt2Q8BG36 561 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Cavin4A2AMM0 362 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 ThemisQ8BGW0 636 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 CrbnQ8C7D2 445 aa15.63■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Amotl1Q9D4H4 968 aa15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tnks1bp1P58871 1720 aa15.62■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Trpm3Q5F4S9 1721 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mast2Q60592 1734 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fam50bQ9WTJ8 334 aa15.61■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ciz1Q8VEH2 845 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Fbln2P37889 1221 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Dusp27Q148W8 1138 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa15.6■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Swt1Q9DBQ9 907 aa15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ltbp1Q8CG19 1712 aa15.59■□□□□ 0.09
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa15.58■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ginm1Q91WR6 327 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Mst1rQ62190 1378 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Neurod2Q62414 383 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ofd1Q80Z25 1017 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Ankrd23Q812A3 306 aa15.56■□□□□ 0.08
Rabgef1-203ENSMUST00000119797 Tns2Q8CGB6 1400 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms