RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm10563F6WIE4 79 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 L3mbtl2P59178 703 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zranb1Q7M760 708 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cep170bQ80U49 1574 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sugp2Q8CH09 1067 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tom1O88746 492 aa11.25□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kcnh5Q920E3 988 aa11.24□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cadps2Q8BYR5 1297 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdlim2Q8R1G6 349 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Farp2Q91VS8 1065 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cluap1Q8R3P7 413 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zmym3Q9JLM4 1370 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NudcO35685 332 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem94Q7TSH8 1360 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gimap5Q8BWF2 308 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slain2Q8CI08 581 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa11.23□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif1aP33173 1695 aa11.22□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q3TQI7 289 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PtpruB1AUH1 1446 aa11.22□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zhx1P70121 873 aa11.22□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ddrgk1Q80WW9 315 aa11.21□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acsbg1Q99PU5 721 aa11.21□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zeb2Q9R0G7 1215 aa11.21□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa11.21□□□□□ -0.61
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bcl2l13P59017 434 aa11.21□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zscan21Q07231 555 aa11.21□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SlkO54988 1233 aa11.21□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Clcn1Q64347 994 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col14a1Q80X19 1797 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 KdrP35918 1367 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Samd1D3YXK1 519 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gys2Q8VCB3 704 aa11.2□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajc14Q921R4 703 aa11.19□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp7bQ64446 1462 aa11.19□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa11.19□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 VgfQ0VGU4 617 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MpndQ3TV65 487 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fbxo3Q9DC63 480 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Adgrl1Q80TR1 1466 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem2Q5FWI3 1383 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Emilin2Q8K482 1074 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map3k19E9Q3S4 1311 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lekr1B2RVN1 116 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 BbxQ8VBW5 907 aa11.18□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fmnl2A2APV2 1086 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Il4rP16382 810 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ift172Q6VH22 1749 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Q7TT23 1179 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dmrt2Q8BG36 561 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Klf15Q9EPW2 415 aa11.17□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plekhd1B2RPU2 505 aa11.16□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa11.16□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ripk4Q9ERK0 786 aa11.16□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NinlQ6ZQ12 1394 aa11.16□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Scn4aQ9ER60 1841 aa11.16□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GnpatP98192 678 aa11.15□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ncoa4Q5U4H9 625 aa11.15□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tsen2Q6P7W5 460 aa11.15□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wdr17E9Q271 1322 aa11.15□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa11.15□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ksr2Q3UVC0 959 aa11.15□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif16bB1AVY7 1312 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Esx1O88933 382 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abca14E9Q8F8 1683 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chmp5Q9D7S9 219 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Idi1P58044 227 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam13bQ8K2H3 851 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Golga2Q921M4 999 aa11.14□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa11.13□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Brinp3Q499E0 766 aa11.13□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam135bQ9DAI6 1403 aa11.13□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Chmp3Q9CQ10 224 aa11.13□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa11.13□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Erich6bQ9D4S6 220 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Plcb2A3KGF7 1181 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Abcc10Q8R4P9 1501 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dennd6aQ8BH65 605 aa11.12□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CemipQ8BI06 1361 aa11.11□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa11.11□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stac3Q8BZ71 360 aa11.11□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atp10bB1AWN4 1474 aa11.1□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mon2Q80TL7 1715 aa11.1□□□□□ -0.63
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kif24Q6NWW5 1356 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms