RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX26Q8N6G2 289 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 P3H4Q92791 437 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB7BQ96AH8 199 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HAUS1Q96CS2 278 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC6A18Q96N87 628 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MYOCQ99972 504 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SEMA3CQ99985 751 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 EDEM2Q9BV94 578 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP41Q9BYV8 373 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NOD2Q9HC29 1040 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPN10Q9HC96 672 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PREBQ9HCU5 417 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 FZD3Q9NPG1 666 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ITM2BQ9Y287 266 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 USP34Q70CQ2 3546 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 H7C0C1 242 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 LATO43561 262 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPAN6O43657 245 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AP1G1O43747 822 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT1P04628 370 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CR2P20023 1033 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CD38P28907 300 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXD12P35452 270 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ID4P47928 161 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5OP48047 213 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NR2C2P49116 596 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 C21orf59P57076 290 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 COPS2P61201 443 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AP1S1P61966 158 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 BNC1Q01954 994 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DSC2Q02487 901 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GSE1Q14687 1217 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRRQ15256 657 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 UGP2Q16851 508 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF284Q2VY69 593 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HLA-BQ31612 363 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM69Q86WT6 500 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MAML1Q92585 1016 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ALG3Q92685 438 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HDAC11Q96DB2 347 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 RMDN1Q96DB5 314 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 AGAP3Q96P47 875 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MGME1Q9BQP7 344 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GAREM1Q9H706 876 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf88Q9H8K7 445 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 DKK3Q9UBP4 350 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 COQ6Q9Y2Z9 468 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 CACNA1HO95180 2353 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-211ENST00000588374 C10orf142B7Z368 130 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms