RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542557.5

PTPRO-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 2,946 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-208ENST00000542557 MARC1Q5VT66 337 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRO-208ENST00000542557 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRO-208ENST00000542557 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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PTPRO-208ENST00000542557 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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PTPRO-208ENST00000542557 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 CNSTQ6PJW8 725 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRO-208ENST00000542557 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
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