RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 SARDHQ9UL12 918 aa7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF292O60281 2723 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 FAM170BA6NMN3 283 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 C10orf142B7Z368 130 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 E7ESA3 106 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SMAPO00193 183 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 USP12O75317 370 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PMPCBO75439 489 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 LEFTY1O75610 366 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PGLSO95336 258 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PIGNO95427 931 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 AGTP01019 485 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 EPHX1P07099 455 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ITIH2P19823 946 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ACTN2P35609 894 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 WASP42768 502 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CHRNA4P43681 627 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ID4P47928 161 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ITGA8P53708 1063 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 GEMP55040 296 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CDK18Q07002 472 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC32Q14392 662 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SPARCL1Q14515 664 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 E2F5Q15329 346 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CRY1Q16526 586 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ACCSLQ4AC99 568 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SYCP2LQ5T4T6 812 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SYT13Q7L8C5 426 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 STK40Q8N2I9 435 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 TMIEQ8NEW7 156 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 IPMKQ8NFU5 416 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 UBXN4Q92575 508 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SERPINB12Q96P63 405 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 FAM129AQ9BZQ8 928 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SEMA4AQ9H3S1 761 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 DKK3Q9UBP4 350 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 IL36AQ9UHA7 158 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 RAB21Q9UL25 225 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa7.89□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 AVILO75366 819 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 NEBLO76041 1014 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 NDST3O95803 873 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PRNPP04156 253 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 UGT2B4P06133 528 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 MLNP12872 115 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 HOXB2P14652 356 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ITGB7P26010 798 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SERPINA4P29622 427 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 DRD3P35462 400 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 RPL26P61254 145 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 VSNL1P62760 191 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 FOXK2Q01167 660 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ITKQ08881 620 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CUL1Q13616 776 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 PRPSAP1Q14558 356 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 GRM3Q14832 879 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 UBXN2BQ14CS0 331 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ELF2Q15723 593 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SLC1A5Q15758 541 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 CDKN3Q16667 212 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 QPCTQ16769 361 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 MSS51Q4VC12 460 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 ARSIQ5FYB1 569 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.88□□□□□ -1.15
C16orf62-211ENST00000540101 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms