RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PTPRDP23468 1912 aa5.04□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 MFSD11O43934 449 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PMPCBO75439 489 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PRNPP04156 253 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PIRTP0C851 137 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 FERMT1Q9BQL6 677 aa5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 ASMTLO95671 621 aa5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 MMP13P45452 471 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CLDN2P57739 230 aa5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 PID1Q7Z2X4 250 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 GDAP1Q8TB36 358 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 CXorf40AQ8TE69 158 aa5.03□□□□□ -1.6
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CLVS1-205ENST00000519846 PTPRN2Q92932 1015 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 NT5C3BQ969T7 300 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 IFT43Q96FT9 208 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 SEMA3CQ99985 751 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-205ENST00000519846 APOL2Q9BQE5 337 aa5.03□□□□□ -1.6
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