RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486618.1

HDAC3-209, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 711 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-209ENST00000486618 RFPL3O75679 317 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 C1QL1O75973 258 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 USP1O94782 785 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 YEATS4O95619 227 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 IGLV3-19P01714 112 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 C1SP09871 688 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 CISD3P0C7P0 127 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 SV2BQ7L1I2 683 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZAR1Q86SH2 424 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 SPERTQ8NA61 448 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 STON2Q8WXE9 905 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SNX19Q92543 992 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 IGSF8Q969P0 613 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 WBP2Q969T9 261 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 LRRC45Q96CN5 670 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 EPSTI1Q96J88 318 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 CHMP5Q9NZZ3 219 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 GMIPQ9P107 970 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.99□□□□□ -1.29
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HDAC3-209ENST00000486618 MYLKQ15746 1914 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 A8MVJ9 347 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 FRS3O43559 492 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 PAHP00439 452 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 TNNT1P13805 278 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ZNF24P17028 368 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ACO1P21399 889 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 IL12RB1P42701 662 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ASPAP45381 313 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 CENPAP49450 140 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SEMG2Q02383 582 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 CFHR1Q03591 330 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 ENPP2Q13822 863 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 GTF2H3Q13889 308 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 SCARB2Q14108 478 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 MAP7Q14244 749 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 RTP5Q14D33 572 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 INAQ16352 499 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 GEN1Q17RS7 908 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 MSMPQ1L6U9 139 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC3-209ENST00000486618 RRAGBQ5VZM2 374 aa6.98□□□□□ -1.29
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