RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428118.1

AP000532.2-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP000532.2, Length 1,730 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000532.2-201ENST00000428118 GNGT1P63211 74 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 GRIN2CQ14957 1233 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SLC14A2Q15849 920 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MROH9Q5TGP6 573 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RETSATQ6NUM9 610 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 KCNMB4Q86W47 210 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 BPIFB1Q8TDL5 484 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ACDQ96AP0 544 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 IFT43Q96FT9 208 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MCMBPQ9BTE3 642 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 HPS4Q9NQG7 708 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 FBXO10Q9UK96 956 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ARL5AQ9Y689 179 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.13□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 OR51F1A6NGY5 319 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 AP3B1O00203 1094 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TYROBPO43914 113 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RFPL1O75677 317 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 VAPBO95292 243 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 EPOP01588 193 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 FGF1P05230 155 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ADH5P11766 374 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 KRT4P19013 534 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 HLA-DPA1P20036 260 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 GABRB3P28472 473 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ATP5DP30049 168 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 PGGT1BP53609 377 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SLC12A1Q13621 1099 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 LRRC14Q15048 493 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MGARPQ8TDB4 240 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 PPP2R3CQ969Q6 453 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RANBP9Q96S59 729 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MTG2Q9H4K7 406 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 GDE1Q9NZC3 331 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ZFATQ9P243 1243 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CDH7Q9ULB5 785 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MTCH2Q9Y6C9 303 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 HEATR9A2RTY3 570 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 FZD6O60353 706 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 WDR4P57081 412 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MPP1Q00013 466 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 GRM2Q14416 872 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 QPCTQ16769 361 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MBLAC2Q68D91 279 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TAOK1Q7L7X3 1001 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 TTC8Q8TAM2 541 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 NXPE3Q969Y0 559 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CHFRQ96EP1 664 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 MYO19Q96H55 970 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 KXD1Q9BQD3 176 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 POMKQ9H5K3 350 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 CLDND1Q9NY35 253 aa11.12□□□□□ -0.63
AP000532.2-201ENST00000428118 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms