RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ST6GAL1P15907 406 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLRC2P26717 231 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 MCM7P33993 719 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLCNKBP51801 687 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 GALCP54803 685 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 RBP5P82980 135 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPARDQ03181 441 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXI1Q12951 378 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTA1Q13330 715 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 RUNX2Q13950 521 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRY2Q49AN0 593 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYTL3Q4VX76 610 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KRT79Q5XKE5 535 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM47EQ6ZV65 393 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM74Q86UV6 250 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRIM73Q86UV7 250 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNX32Q86XE0 403 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TDRPQ86YL5 185 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMC8Q8IU68 726 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 THNSL1Q8IYQ7 743 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 OR8H3Q8N146 312 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q8NFD4 153 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF398Q8TD17 642 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAVIN3Q969G5 261 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS33AQ96AX1 596 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF503Q96F45 646 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TM2D2Q9BX73 214 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 HRH4Q9H3N8 390 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLK3Q9H4B4 646 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRPEL1Q9HAV7 217 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF304Q9HCX3 659 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SETD4Q9NVD3 440 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
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RNU6-272P-201ENST00000411028 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC72A6NJI9 287 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLRF2D3W0D1 207 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC25A17O43808 307 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 AVILO75366 819 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEURL1O76050 574 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMCC1O94876 653 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 NKX2-2O95096 273 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLAUP00749 431 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPOP07202 933 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC175P0C221 793 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTN1P12814 892 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TFEBP19484 476 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITGAXP20702 1163 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPHB2P29323 1055 aa4.51□□□□□ -1.69
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RNU6-272P-201ENST00000411028 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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RNU6-272P-201ENST00000411028 RARRES1P49788 294 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLP2Q04941 152 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRAPQ13588 217 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKP1Q13835 747 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 NAB2Q15742 525 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 TCTN1Q2MV58 587 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP41Q3LFD5 358 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 AAGABQ6PD74 315 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SEPT14Q6ZU15 432 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CEP97Q8IW35 865 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAGE1Q8TC20 777 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 KAT2AQ92830 837 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 DGAT2Q96PD7 388 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-272P-201ENST00000411028 SIN3AQ96ST3 1273 aa4.51□□□□□ -1.69
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