RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1W2PR77 199 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 E7ENQ6 273 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TLR4O00206 839 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NPC1O15118 1278 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GSTA4O15217 222 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC31A1O15431 190 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SIGLEC6O43699 453 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 USP12O75317 370 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 IL33O95760 270 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZBED1O96006 694 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FAM163BP0C2L3 166 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CKMT2P17540 419 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC8A1P32418 973 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 VAMP7P51809 220 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ADPRHP54922 357 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMPRSS3P57727 454 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NXPH1P58417 271 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF445P59923 1031 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GPR85P60893 370 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PPP3CAQ08209 521 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 INCA1Q0VD86 236 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 STK4Q13043 487 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC39A14Q15043 492 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NKG7Q16617 165 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 C1orf220Q5T0J3 134 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 UNC93AQ86WB7 457 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CPXM2Q8N436 756 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 IQUBQ8NA54 791 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLC4A11Q8NBS3 891 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KIAA0895Q8NCT3 520 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF248Q8NDW4 579 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 OR2T34Q8NGX1 318 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SEMA4DQ92854 862 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SKA1Q96BD8 255 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CALN1Q9BXU9 219 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 DUSP16Q9BY84 665 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 GPR27Q9NS67 375 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 CISHQ9NSE2 258 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 COX16Q9P0S2 106 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 MTMR6Q9Y217 621 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.91□□□□□ -1.62
TMLHE-202ENST00000369439 A0A1B0GVM2 712 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 CPED1A4D0V7 1026 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 PMM2O15305 246 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 TIMM44O43615 452 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 CSO75390 466 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 NEBLO76041 1014 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 LRIG2O94898 1065 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 KRT13P13646 458 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 PDGFRAP16234 1089 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 PDCP20941 246 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 NR2F2P24468 414 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 ECI1P42126 302 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 ME1P48163 572 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF132P52740 706 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 AP3M2P53677 418 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 RAD23BP54727 409 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 SLC8A3P57103 927 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 CLDN2P57739 230 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 RAC1P63000 192 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 PAK1Q13153 545 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 RTP5Q14D33 572 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 TESK1Q15569 626 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TMLHE-202ENST00000369439 ACCSLQ4AC99 568 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms