RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 STRA6Q9BX79 667 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SEC22BO75396 215 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SEMA5AQ13591 1074 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 VPS33AQ96AX1 596 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 REPS1Q96D71 796 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SPATA17Q96L03 361 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF23P17027 643 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RIPK1Q13546 671 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TXNDC11Q6PKC3 985 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MED8Q96G25 268 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CDRT15Q96T59 188 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 BBS2Q9BXC9 721 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TJP1Q07157 1748 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TCEA3O75764 348 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 COL6A1P12109 1028 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CDH4P55283 916 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GJA9P57773 515 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MPPE1Q53F39 396 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 DHFR2Q86XF0 187 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RASAL3Q86YV0 1011 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CCT7Q99832 543 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.61■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IRAK2O43187 625 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 C1RP00736 705 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 PBX3P40426 434 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SULT2A1Q06520 285 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1B0GVM2 712 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TCAF2A6NFQ2 919 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 DNM1LO00429 736 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RASSF9O75901 435 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SLC1A5Q15758 541 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TEKT5Q96M29 485 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 OMDQ99983 421 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 F8W810 466 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ACADMP11310 421 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 LIMK2P53671 638 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GNA12Q03113 381 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GRM3Q14832 879 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IL27RAQ6UWB1 636 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MECRQ9BV79 373 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GRIN2DO15399 1336 aa16.6■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ARVCFO00192 962 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MAGEC1O60732 1142 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 HCAR3P49019 387 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SQLEQ14534 574 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 C11orf96Q7Z7L8 435 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 XYLT2Q9H1B5 865 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 COMMD8Q9NX08 183 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SCN3BQ9NY72 215 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 SPACA6W5XKT8 324 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TLL1O43897 1013 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 C1orf220Q5T0J3 134 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 RBFAQ8N0V3 343 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ATL1Q8WXF7 558 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 THAP11Q96EK4 314 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 WDR41Q9HAD4 459 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CHKBQ9Y259 395 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 IFNA14P01570 189 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 ATP6V1E1P36543 226 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 NEK3P51956 506 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 STARD8Q92502 1023 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 MYO19Q96H55 970 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 GPR88Q9GZN0 384 aa16.59■□□□□ 0.25
ITGA3-202ENST00000320031 CAB39LQ9H9S4 337 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms