RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064190.12

Rai1-201, Transcript of Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rai1, Length 7,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1-201ENSMUST00000064190 Angel1Q8VCU0 667 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Yipf2Q99LP8 312 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rcan1Q9JHG6 198 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 DguokQ9QX60 277 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Soat1Q61263 540 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sema3cQ62181 751 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Xlr3bQ6P205 226 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr857Q7TRF7 309 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Usp26Q99MX1 835 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Arhgef11Q68FM7 1552 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Etnk2A7MCT6 385 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dcpp2E9PYC2 171 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr220E9Q050 325 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dcpp1L7N1X9 171 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Map2k3O09110 347 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 LipeP54310 759 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Clic5Q8BXK9 251 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Alx1Q8C8B0 326 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ints11Q9CWS4 600 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ribc2Q9D4Q1 309 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rnft1Q9DCN7 395 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hipk3Q9ERH7 1192 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tbx20Q9ES03 445 aa16.12■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Orm1Q60590 207 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Arhgef33Q8BW86 850 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Angel2Q8K1C0 544 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmco1Q921L3 188 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tma16Q9CR02 221 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ap3s1Q9DCR2 193 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ssxb9A2BI93 185 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn2r53L7N473 806 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 SgcdP82347 289 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mtmr11Q3V1L6 700 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ago4Q8CJF8 861 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Snapc2Q91XA5 359 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Uckl1Q91YL3 548 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Oxct1Q9D0K2 520 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Aif1lQ9EQX4 150 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 IkbkeQ9R0T8 717 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Psmd3P14685 530 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Clec3bP43025 202 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Atg9aQ68FE2 551 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp810Q99K45 461 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rpl38Q9JJI8 70 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 DgkeQ9R1C6 564 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 H2-Eb1P04230 264 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Grb7Q03160 535 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ssxb3Q6XAS4 170 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Usp45Q8K387 813 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plcl2Q8K394 1128 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Scube3Q66PY1 993 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Samd7Q8C8Y5 445 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Efcab7Q8VDY4 628 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pgam1Q9DBJ1 254 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Arl10Q9QXJ4 243 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn2r25W4VSP2 855 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fam71e2L7N480 754 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ctps1P70698 591 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slfn4Q3UV66 602 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Bcl2a1bQ497M6 172 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc39a12Q5FWH7 689 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sephs1Q8BH69 392 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 BlmhQ8R016 455 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mcoln3Q8R4F0 553 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 CatsperzQ9CQP8 194 aa16.11■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 CtskP55097 329 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Polr2mQ6P6I6 366 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 LrmdaQ9D9B4 229 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mtx3D3YTP3 312 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vmn2r42O35192 852 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 RxraP28700 467 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Olfr1484Q8VEU6 315 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Arih1Q9Z1K5 555 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Klra1P20937 262 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fam89aQ14BJ1 175 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Psd2Q6P1I6 770 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gimap3Q99MI6 301 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Znf804aA2AKY4 1200 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp780bE9Q2S6 806 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ctbp1O88712 441 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rnft2Q3UF64 445 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Q5EBG8 199 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rcbtb1Q6NXM2 531 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp438Q8BFX2 798 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plekha1Q8BUL6 383 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pgm5Q8BZF8 567 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 MastlQ8C0P0 865 aa16.1■□□□□ 0.17
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gcnt4E9Q649 455 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.9 ms