RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Itgb8Q0VBD0 767 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Znf367Q0VDT2 340 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim67Q505D9 768 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Btnl1Q7TST0 509 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pex26Q8BGI5 305 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PolbQ8K409 335 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ing3Q8VEK6 421 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 St13Q99L47 371 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ndufa5Q9CPP6 116 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ly6kQ9CWP4 154 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hcar2Q9EP66 360 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Spag4Q9JJF2 443 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CtsfQ9R013 462 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col4a3Q9QZS0 1669 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 CercamA3KGW5 592 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mmp15O54732 657 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01644 108 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01645 108 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01646 108 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 P01647 108 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tekt4Q149S1 447 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DtlQ3TLR7 729 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FancbQ5XJY6 703 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mapk10Q61831 464 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dyrk4Q8BI55 632 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap22Q8BL80 702 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem74Q8BQU7 305 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cops7bQ8BV13 264 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lurap1lQ8K2P1 221 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 OafQ8QZR4 282 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rps6kl1Q8R2S1 544 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr1499Q8VG65 314 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Oas1dQ8VI95 361 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NifkQ91VE6 317 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pcdhga4Q91XY4 930 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 DeraQ91YP3 318 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dusp6Q9DBB1 381 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gipc2Q9Z2H7 314 aa9.03□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr456B2RT27 312 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mroh4G3X8W1 983 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MntO08789 591 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slc6a20bO88575 635 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akap3O88987 864 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AurkaP97477 395 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zmym5Q3U2E2 627 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gngt2Q61017 69 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 AftphQ80WT5 931 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TiparpQ8C1B2 657 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gtse1Q8R080 741 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prrg2Q8R182 198 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr458Q8VF80 313 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Olfr457Q8VGP5 313 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Isoc1Q91V64 297 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Yaf2Q99LW6 179 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cd302Q9DCG2 228 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Asb4Q9WV71 426 aa9.02□□□□□ -0.96
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Aldoart1A6ZI46 419 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ap1g1P22892 822 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Wnt7bP28047 349 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prox1P48437 737 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hhla1Q3TYV2 514 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tcf4Q60722 670 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Itga2Q62469 1178 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pla2g4cQ64GA5 597 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arhgap26Q6ZQ82 814 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hmbox1Q8BJA3 419 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpc5Q8CAL5 572 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Socs7Q8VHQ2 579 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trpv6Q91WD2 767 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dhrs7Q9CXR1 338 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Snf8Q9CZ28 258 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TrirQ9D735 173 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dach1Q9QYB2 751 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Supt3B0QZW4 406 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Unc13dB2RUP2 1085 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zar1lC3VD30 291 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm11236J3QMS7 360 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdlim1O70400 327 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hoxb8P09632 243 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gas2P11862 314 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akt1P31750 480 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gata6Q61169 589 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acvrl1Q61288 502 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sema5aQ62217 1077 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc116Q80X53 541 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gxylt2Q810K9 444 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Iars2Q8BIJ6 1012 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Samd7Q8C8Y5 445 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tasp1Q8R1G1 420 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Vangl2Q91ZD4 521 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FdpsQ920E5 353 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Slco1a4Q9EP96 670 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MkksQ9JI70 570 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rps6kb2Q9Z1M4 485 aa9.02□□□□□ -0.97
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atad5Q4QY64 1826 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.9 ms