RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-208ENST00000490163 MPOP05164 745 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GZMAP12544 262 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 VCLP18206 1134 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ITGB7P26010 798 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MSNP26038 577 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PTPN4P29074 926 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CCND2P30279 289 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TTKP33981 857 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PGM1P36871 562 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DYRK1AQ13627 763 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANKS6Q68DC2 871 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RRAGAQ7L523 313 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 C1QL4Q86Z23 238 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ATL1Q8WXF7 558 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FAR2Q96K12 515 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SPATA17Q96L03 361 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 HAPLN3Q96S86 360 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SIN3AQ96ST3 1273 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 Q9N2J8 555 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FAM205AQ6ZU69 1335 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TRBC2A0A5B9 178 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FAM157AC9JC47 383 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 WNT9BO14905 357 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CYP26A1O43174 497 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DIAPH2O60879 1101 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 APOL3O95236 402 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 NRIP1P48552 1158 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CDR1P51861 262 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC12A2P55011 1212 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SIRPAP78324 504 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 EGR4Q05215 589 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PPP2R5CQ13362 524 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KCNB1Q14721 858 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 EPC2Q52LR7 807 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 WDR93Q6P2C0 686 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 NLRP14Q86W24 1093 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DBF4BQ8NFT6 615 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SLC6A17Q9H1V8 727 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 USP22Q9UPT9 525 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 A2ML1A8K2U0 1454 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PTPRMP28827 1452 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 USP17L23D6RBM5 183 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 F8WDY8 70 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 HMMRO75330 724 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MED14OSP0DP75 135 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FCER1AP12319 257 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RXRAP19793 462 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 PBX3P40426 434 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 IL15P40933 162 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MTA1Q13330 715 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KCNAB1Q14722 419 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZNF667Q5HYK9 610 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 OTUD6BQ8N6M0 293 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 EEF2KMTQ96G04 330 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FNBP1Q96RU3 617 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 SYT3Q9BQG1 590 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TLR10Q9BXR5 811 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RNF32Q9H0A6 362 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 MMP27Q9H306 513 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 POLE3Q9NRF9 147 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ANO10Q9NW15 660 aa3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ZBED9Q6R2W3 1325 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 AGFG2O95081 481 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 LINGO3P0C6S8 592 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 ACTN1P12814 892 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RABGGTBP53611 331 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 RHAGQ02094 409 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 GAGE2BQ13066 116 aa3.05□□□□□ -1.92
UBXN4-208ENST00000490163 KLF10Q13118 480 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms