RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MYLK3Q32MK0 819 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 HS1BP3Q53T59 392 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ZNF805Q5CZA5 627 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 SCYL2Q6P3W7 929 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ZNF354CQ86Y25 554 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TMEM139Q8IV31 216 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RBFAQ8N0V3 343 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.81□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP12.8□□□□□ -0.367e-14■■□□□ 11.7
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PRAME-212ENST00000485532 CDKN3Q16667 212 aa12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 PARGQ86W56 976 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 LMX1AQ8TE12 382 aa12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 KCNF1Q9H3M0 494 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 PRORYQ9H606 182 aa12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 RP1P56715 2156 aa12.8□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ATMQ13315 3056 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa12.79□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 AREL1O15033 823 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RRP8O43159 456 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 AQP9O43315 295 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN6O43657 245 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CREB3O43889 395 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 USP12O75317 370 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CSO75390 466 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 PRKCIP41743 596 aa12.79□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TCEA2Q15560 299 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 TBC1D25Q3MII6 688 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 NYAP1Q6ZVC0 841 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 MON1BQ7L1V2 547 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa12.79□□□□□ -0.36
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PRAME-212ENST00000485532 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 FAM181AQ8N9Y4 354 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 NTAN1Q96AB6 310 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 RAB7BQ96AH8 199 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 CENPTQ96BT3 561 aa12.79□□□□□ -0.36
PRAME-212ENST00000485532 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
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