RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 IL22Q9GZX6 179 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TASP1Q9H6P5 420 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 OXSMQ9NWU1 459 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CDH7Q9ULB5 785 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 C9IYK1 514 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PLOD2O00469 737 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PTGESO14684 152 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TREHO43280 583 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 C8BP07358 591 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SAT1P21673 171 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SLC5A3P53794 718 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GJA9P57773 515 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 RAB15P59190 212 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GRB14Q14449 540 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MFSD10Q14728 455 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GRM3Q14832 879 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ABHD8Q96I13 439 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MCMBPQ9BTE3 642 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TBC1D23Q9NUY8 699 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MID2Q9UJV3 735 aa18.24■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TK2O00142 265 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 NEMP1O14524 444 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 JCHAINP01591 159 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.514e-12■■■□□ 16.3
SSR4-209ENST00000482902 ITGA7Q13683 1181 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ANO4Q32M45 955 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 FAM35AQ86V20 835 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CPNE9Q8IYJ1 553 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 NPLOC4Q8TAT6 608 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CNGB3Q9NQW8 809 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TLK1Q9UKI8 766 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 DOLKQ9UPQ8 538 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 FUOMA2VDF0 154 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CCR10P46092 362 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PGGT1BP53609 377 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 KRT80Q6KB66 452 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GPR141Q7Z602 305 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MYO1HQ8N1T3 1032 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 EDEM1Q92611 657 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SENP8Q96LD8 212 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TEKT5Q96M29 485 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 APBA2Q99767 749 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 COQ6Q9Y2Z9 468 aa18.23■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TRIM64CA6NLI5 447 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 MATN2O00339 956 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 FBP2O00757 339 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SLC22A2O15244 555 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 APOA4P06727 396 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 HALP42357 657 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GRIA4P48058 902 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CD151P48509 253 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CDH17Q12864 832 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 DCDC5Q6ZRR9 648 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PCED1BQ96HM7 432 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 VAT1Q99536 393 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 GPR22Q99680 433 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SLC29A1Q99808 456 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 WDCPQ9H6R7 721 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 SELENONQ9NZV5 590 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 RAP2CQ9Y3L5 183 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 TSC2P49815 1807 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 ADAM23O75077 832 aa18.22■□□□□ 0.51
SSR4-209ENST00000482902 CSPG5O95196 566 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms