RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GGPS1O95749 300 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IL33O95760 270 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 LGALS2P05162 132 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 KRT10P13645 584 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CLCN4P51793 760 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 UCP3P55916 312 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 LINC00205P59089 165 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 FAM193AP78312 1265 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 E2F1Q01094 437 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GIT2Q14161 759 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 STXBP2Q15833 593 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZNF280BQ86YH2 543 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CUL5Q93034 780 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZBP1Q9H171 429 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 PRORYQ9H606 182 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IL17BQ9UHF5 180 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CACNA1DQ01668 2161 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 WDR81Q562E7 1941 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 F5P12259 2224 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 M0QZ92 97 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MGEA5O60502 916 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CTSAP10619 480 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 AKAP5P24588 427 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CCKARP32238 428 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SLC11A2P49281 568 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 C10orf25Q5T742 122 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MTSS1LQ765P7 747 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 LRRC43Q8N309 656 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 C2orf42Q9NWW7 574 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ASIC5Q9NY37 505 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 AP4M1O00189 453 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IGSF3O75054 1194 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 THP07101 528 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SLC16A2P36021 539 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 DGKEP52429 567 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IGBP1P78318 339 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GHRHRQ02643 423 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 LY6DQ14210 128 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZNF398Q8TD17 642 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 FAM3CQ92520 227 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CASD1Q96PB1 797 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 PRR25Q96S07 402 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MMS19Q96T76 1030 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GINS2Q9Y248 185 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 FBN3Q75N90 2809 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 PI4KAP42356 2102 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 POLQO75417 2590 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 MYO1CO00159 1063 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 ADAM10O14672 748 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 GCATO75600 419 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 PRDM1O75626 825 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 IRX4P78413 519 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 CCDC96Q2M329 555 aa6.24□□□□□ -1.41
RBM39-232ENST00000481037 USH1GQ495M9 461 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms