RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ITPKCQ96DU7 683 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TCF12Q99081 682 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SPON1Q9HCB6 807 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MID2Q9UJV3 735 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 FZD10Q9ULW2 581 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TNFSF13BQ9Y275 285 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa13.66□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 UBDO15205 165 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 AP2A1O95782 977 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNA5P22460 613 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ATICP31939 592 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 BMXP51813 675 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 LDLRAP1Q5SW96 308 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PELI3Q8N2H9 469 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 GPR22Q99680 433 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 TARM1B6A8C7 271 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 E2F6O75461 281 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 AHSGP02765 367 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 DCKP27707 260 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 OXTRP30559 389 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 GLUD2P49448 558 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 RABGGTBP53611 331 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZBTB17Q13105 803 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 STX5Q13190 355 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CLEC6AQ6EIG7 209 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PIGZQ86VD9 579 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKFN1Q8N957 763 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 BRD8Q9H0E9 1235 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CD300AQ9UGN4 299 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CROTQ9UKG9 612 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 V9GYQ6 96 aa13.65□□□□□ -0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A087WZ62 844 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SLCO1B7G3V0H7 640 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 B4GAT1O43505 415 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 GPC4O75487 556 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNH1O95259 989 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 APOA4P06727 396 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 PTPRAP18433 802 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NFKB1P19838 968 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ICAM3P32942 547 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CD68P34810 354 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 RBP5P82980 135 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TNK2Q07912 1038 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MERTKQ12866 999 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC12A1Q13621 1099 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CYP2A13Q16696 494 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD8Q6ZWB6 473 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC26A9Q7LBE3 791 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ERMP1Q7Z2K6 904 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC15A4Q8N697 577 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T34Q8NGX1 318 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2T3Q8NH03 318 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 USP33Q8TEY7 942 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SCN1AP35498 2009 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 TRPC5OSA6NMA1 111 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 BAIAP3O94812 1187 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NCAM1P13591 858 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRM3P20309 590 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 NR1D2Q14995 579 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM35AQ86V20 835 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 COPS5Q92905 334 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 PHF21BQ96EK2 531 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CASS4Q9NQ75 786 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 CHST12Q9NRB3 414 aa13.64□□□□□ -0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 SARDHQ9UL12 918 aa13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms