RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PMS2CLQ68D20 193 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC17AQ6ZS10 378 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MOB3CQ70IA8 216 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ABI1Q8IZP0 508 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD35Q8N283 1001 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SCAIQ8N9R8 606 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IQUBQ8NA54 791 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NACC2Q96BF6 587 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF31Q96EP0 1072 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ERO1AQ96HE7 468 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM84AQ96KN4 292 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 DACH2Q96NX9 599 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TSGA13Q96PP4 275 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MGME1Q9BQP7 344 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NUP85Q9BW27 656 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 THAP9Q9H5L6 903 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM74BQ9NUR3 256 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GABRQQ9UN88 632 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.83□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GAPVD1Q14C86 1478 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM247A6NEH6 219 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM64CA6NLI5 447 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MCIDASD6RGH6 385 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AP4M1O00189 453 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN9O14815 690 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 USP12O75317 370 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CBX6O95503 412 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 HLA-DQA2P01906 255 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TFP02787 698 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SRCP12931 536 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TYK2P29597 1187 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 STAT6P42226 847 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MTHFRP42898 656 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 VAV2P52735 878 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RABGGTBP53611 331 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TPTEP56180 551 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBB4BP68371 445 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GPC5P78333 572 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 JAG1P78504 1218 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F1Q01094 437 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TFAP4Q01664 338 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ITIH3Q06033 890 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSM2AQ08AH3 577 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RPA4Q13156 261 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 NAB2Q15742 525 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 IQCHQ86VS3 1027 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 D2HGDHQ8N465 521 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CAMKVQ8NCB2 501 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SPATA20Q8TB22 786 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LOXL4Q96JB6 756 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 RUNDC3BQ96NL0 473 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR78Q96P69 363 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 OR14A2Q96R54 314 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX18Q96RF0 628 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 MNTQ99583 582 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNK12Q9HB15 430 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AMFRQ9UKV5 643 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CBX1P4-201ENST00000439415 CMAHPQ9Y471 501 aa4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms