RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364385.1

RNU6-990P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 990, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-990P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-990P-201ENST00000364385 NEUROD6Q96NK8 337 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 SLC2A13Q96QE2 648 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 DNAJC7Q99615 494 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ARID3AQ99856 593 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ZNF670Q9BS34 389 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 SLC39A8Q9C0K1 460 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 RAD21L1Q9H4I0 556 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 SFXN1Q9H9B4 322 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 RXFP3Q9NSD7 469 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ZNF581Q9P0T4 197 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 SEL1LQ9UBV2 794 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IL17BQ9UHF5 180 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KLK12Q9UKR0 248 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KCNS2Q9ULS6 477 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 MAPRE3Q9UPY8 281 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 COL1A2P08123 1366 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 STK36Q9NRP7 1315 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 A0A087WW49 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 A0A1W2PPR1 153 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CPED1A4D0V7 1026 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KCNJ18B7U540 433 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CHL1O00533 1208 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 HSPB6O14558 160 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PER2O15055 1255 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 MID1O15344 667 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 RNMTO43148 476 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 RRP9O43818 475 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 LRP3O75074 770 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 WDR1O75083 606 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 INMTO95050 263 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 C22orf31O95567 290 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CLPTM1O96005 669 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGKV2D-28P01615 120 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGLV3-19P01714 112 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGHV4-39P01824 125 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CD5P06127 495 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 GYS1P13807 737 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TMPOP42166 694 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 GPR3P46089 330 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CYP2J2P51589 502 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 EPHB1P54762 984 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 LINC00315P59091 139 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CYP4A11Q02928 519 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 UBE4AQ14139 1066 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 C16orf72Q14CZ0 275 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 NECTIN1Q15223 517 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 EIPR1Q53HC9 387 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TECRLQ5HYJ1 363 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KCNT1Q5JUK3 1230 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 WLSQ5T9L3 541 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 IGFL2Q6UWQ7 119 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 OLFM4Q6UX06 510 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 EID3Q8N140 333 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 C11orf42Q8N5U0 333 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 CD177Q8N6Q3 437 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TYMSOSQ8TAI1 123 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 BBS10Q8TAM1 723 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 OVCA2Q8WZ82 227 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 BADQ92934 168 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 SPSB4Q96A44 273 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 OTULINQ96BN8 352 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ARHGEF26Q96DR7 871 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 NSMCE3Q96MG7 304 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 PNPOQ9NVS9 261 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 C14orf119Q9NWQ9 140 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 NUDT4Q9NZJ9 180 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 LRWD1Q9UFC0 647 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 GTF3C4Q9UKN8 822 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KCNJ14Q9UNX9 436 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 AMDHD2Q9Y303 409 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 ARID1AO14497 2285 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 COL15A1P39059 1388 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 LMTK3Q96Q04 1460 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-990P-201ENST00000364385 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms