RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERV3-1Q14264 604 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFSD4BQ5TF39 518 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RUBCNQ92622 972 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACDQ96AP0 544 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP85Q9BW27 656 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NME7Q9Y5B8 376 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIOO75962 3097 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MYO7AQ13402 2215 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTAGE9A4FU28 777 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC16A6O15403 523 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AHSGP02765 367 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GZMAP12544 262 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CXCR5P32302 372 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIR3DL1P43629 444 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NOMO3P69849 1222 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DSC1Q08554 894 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 INCA1Q0VD86 236 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FUT10Q6P4F1 479 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNC93AQ86WB7 457 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFSD4AQ8N468 514 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C3orf20Q8ND61 904 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GAB3Q8WWW8 586 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLPTM1LQ96KA5 538 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SNX22Q96L94 193 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRGPRX4Q96LA9 322 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PREBQ9HCU5 417 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PNPOQ9NVS9 261 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SUFUQ9UMX1 484 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 O00370 1275 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GJB3O75712 270 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTA2O94776 668 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCA5LO95447 670 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM87AP0C7U9 286 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEFHP12036 1026 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANXA13P27216 316 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POLD2P49005 469 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BORAQ6PGQ7 559 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RFFLQ8WZ73 363 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FATE1Q969F0 183 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF558Q96NG5 402 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CPXM1Q96SM3 734 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYT11Q9BT88 431 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM7Q9C029 511 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ISCUQ9H1K1 167 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRANK1O15050 2925 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E5RJQ4 531 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H3BM21 787 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM229AH3BQW9 127 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPOPO43791 374 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM155BO75949 473 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MT-ND5P03915 603 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UQCRHP07919 91 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM200BP0CF97 657 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PMF1Q6P1K2 205 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms