RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 CCR10P46092 362 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 NDST2P52849 883 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SMARCB1Q12824 385 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 NAB1Q13506 487 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 MARC1Q5VT66 337 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 VWCEQ96DN2 955 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 LRCH1Q9Y2L9 728 aa16.29■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 GJB3O75712 270 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 VAPBO95292 243 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 IGLV3-27P01718 113 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 CD86P42081 329 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 DSC2Q02487 901 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 MPP3Q13368 585 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SEPT6Q14141 434 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 LGI2Q8N0V4 545 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 KIFC1Q9BW19 673 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 RAMP2O60895 175 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SP100P23497 879 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 DNAJB2P25686 324 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ADRA1AP35348 466 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 RENBPP51606 427 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 WNT3AP56704 352 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 CDK18Q07002 472 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PCID2Q5JVF3 399 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 RNF220Q5VTB9 566 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 MAPK15Q8TD08 544 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PPP4R1Q8TF05 950 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.28■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 E9PBE3 544 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 F8W8V4 182 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 KLHL41O60662 606 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 TACR2P21452 398 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SLC6A4P31645 630 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 CTBP1Q13363 440 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 IHHQ14623 411 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 STXBP5Q5T5C0 1151 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PDPK2PQ6A1A2 396 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 RNF111Q6ZNA4 994 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 GKN1Q9NS71 199 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.27■□□□□ 0.2
GINS2-201ENST00000253462 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DCXO43602 365 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 LIMK2P53671 638 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 CNGA3Q16281 694 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 IRGCQ6NXR0 463 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 RANBP10Q6VN20 620 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DENND1CQ8IV53 801 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 PIDD1Q9HB75 910 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.27■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 A0A0D9SEW6 157 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DRGXA6NNA5 263 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 ZBTB14O43829 449 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 DEFB103AP81534 67 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 RING1Q06587 406 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 C6orf163Q5TEZ5 329 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 RAPH1Q70E73 1250 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 COG4Q9H9E3 785 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 A0A096LPK6 155 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 F5H5T6 163 aa16.26■□□□□ 0.19
GINS2-201ENST00000253462 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms