RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 HPS6Q86YV9 775 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 DSELQ8IZU8 1212 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 COG1Q8WTW3 980 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SCFD2Q8WU76 684 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ING5Q8WYH8 240 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 USP44Q9H0E7 712 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KCNF1Q9H3M0 494 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PHF24Q9UPV7 400 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF148Q9UQR1 794 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 STARD13Q9Y3M8 1113 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 V9GYQ6 96 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A1B0GUA9 196 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 C2orf71A6NGG8 1288 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CLCA1A8K7I4 914 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC30A4O14863 429 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MUSKO15146 869 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MSH4O15457 936 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RRP9O43818 475 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GRAP2O75791 330 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CABYRO75952 493 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 S1PR4O95977 384 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TFPIP10646 304 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 AGXTP21549 392 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CCNOP22674 350 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CCND2P30279 289 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ACADVLP49748 655 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 OAZ1P54368 228 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 GPX6P59796 221 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 HAND2P61296 217 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ERVK-24P63145 666 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TFAP4Q01664 338 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MGAT5Q09328 741 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RESTQ13127 1097 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF235Q14590 738 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CDK10Q15131 360 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 AKIRIN2Q53H80 203 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM76BQ5HYJ3 339 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MLIPQ5VWP3 458 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 OVOS1Q6IE37 1185 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CASP12Q6UXS9 341 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RNF44Q7L0R7 432 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CHSY1Q86X52 802 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 UEVLDQ8IX04 471 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 OVCA2Q8WZ82 227 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 TP53INP1Q96A56 240 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NEDD4LQ96PU5 975 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CGRRF1Q99675 332 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 MXRA8Q9BRK3 442 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 IGSF5Q9NSI5 407 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ADPRHL2Q9NX46 363 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 CPNE7Q9UBL6 633 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 KCNN3Q9UGI6 736 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 AXIN2Q9Y2T1 843 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ZDHHC9Q9Y397 364 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RTL9Q8NET4 1388 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ANKRD33BA6NCL7 494 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PP2D1A8MPX8 630 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 EYA2O00167 538 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 PLK4O00444 970 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 FOXN1O15353 648 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 ARHGAP6O43182 974 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 RECQL4O94761 1208 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 IPO13O94829 963 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LTFP02788 710 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 JMJD7P0C870 316 aa2.11□□□□□ -2.07
PTPRQ-209ENST00000616559 LHCGRP22888 699 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms