RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB33Q86T24 672 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNC93AQ86WB7 457 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERO1BQ86YB8 467 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EPHX4Q8IUS5 362 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADGRG5Q8IZF4 528 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF567Q8N184 647 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTC30BQ8N4P2 665 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RAB2BQ8WUD1 216 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SEPT8Q92599 483 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DPF3Q92784 378 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NT5C3BQ969T7 300 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PGBD4Q96DM1 585 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC126Q96EE4 140 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VMP1Q96GC9 406 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HPDLQ96IR7 371 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAGED4Q96JG8 741 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HSFY1Q96LI6 401 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYRFLQ96LU7 910 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PHF12Q96QT6 1004 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SLC9A7Q96T83 725 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VAT1Q99536 393 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 APBA2Q99767 749 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TCHPQ9BT92 498 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HGH1Q9BTY7 390 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRMOQ9BU70 441 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIM15Q9C019 465 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDT1Q9H211 546 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NANOGQ9H9S0 305 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMOXQ9NWM0 555 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GID8Q9NWU2 228 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ADA2Q9NZK5 511 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SELENONQ9NZV5 590 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GMIPQ9P107 970 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACTR3BQ9P1U1 418 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TLK1Q9UKI8 766 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PSME2Q9UL46 239 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VANGL2Q9ULK5 521 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NDUFAF1Q9Y375 327 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RIPK3Q9Y572 518 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 A0A1W2PPW3 197 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TCRBV5S2A0A599 114 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DHRS12A0PJE2 317 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GOLGA8TH3BQL2 631 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NEMP1O14524 444 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MRASO14807 208 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GIPC1O14908 333 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCLK1O15075 740 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UBDO15205 165 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLOCKO15516 846 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TIPRLO75663 272 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLPXO76031 633 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRSS23O95084 383 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CSPG5O95196 566 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 STAMBPO95630 424 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NTRK1P04629 796 aa4.54□□□□□ -1.68
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ITGB3P05106 788 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms