RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 AQP5P55064 265 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CRADDP78560 199 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MPP3Q13368 585 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 FAM172AQ8WUF8 416 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 CMTM6Q9NX76 183 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.52□□□□□ -1.04
PDPR-210ENST00000568530 TECPR2O15040 1411 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DIP2BQ9P265 1576 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 UBOX5O94941 541 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 NTSR2O95665 410 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 COPAP53621 1224 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SCN1BQ07699 218 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KRT35Q92764 455 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CHID1Q9BWS9 393 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MARCH7Q9H992 704 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CD84Q9UIB8 345 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DYTNA2CJ06 578 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TISP43B9A030 160 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 BTN3A1O00481 513 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CCND1P24385 295 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CHRNB3Q05901 458 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GPR158Q5T848 1215 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 NPNTQ6UXI9 565 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SNX20Q7Z614 316 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 JAZF1Q86VZ6 243 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 COQ8AQ8NI60 647 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CES2O00748 559 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 EPHB6O15197 1021 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MICAL2O94851 1124 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TIE1P35590 1138 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PLK1P53350 603 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CORO7P57737 925 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 STILQ15468 1287 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CRY1Q16526 586 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 LPAR1Q92633 364 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZNF222Q9UK12 451 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PTPRMP28827 1452 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ME2P23368 584 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PIK3R1P27986 724 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ABCG1P45844 678 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 LHX1P48742 406 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SMCO1Q147U7 214 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RASA2Q15283 850 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MAGEB18Q96M61 343 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.52□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TRIM24O15164 1050 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RAD51BO15315 384 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KLHL2O95198 593 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ATP6V1G2O95670 118 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CYP17A1P05093 508 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MSL3P1P0C860 447 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 BTN3A2P78410 334 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CDKL1Q00532 357 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MEA1Q16626 185 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TTI2Q6NXR4 508 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TCEANCQ8N8B7 351 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TEKT5Q96M29 485 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 MTA3Q9BTC8 594 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 FFAR3O14843 346 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 GPR42O15529 346 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 TMEM253P0C7T8 217 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 AKR1A1P14550 325 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 NFATC2Q13469 925 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 RAB39AQ14964 217 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 WLSQ5T9L3 541 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ERO1BQ86YB8 467 aa8.51□□□□□ -1.05
PDPR-210ENST00000568530 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.6 ms