RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NEK5	Q6P3R8	708 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	H2AFV	Q71UI9	128 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	MYOC	Q99972	504 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TRIM5	Q9C035	493 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DEF6	Q9H4E7	631 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FZD3	Q9NPG1	666 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	DMTF1	Q9Y222	760 aa		21.17	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PCDH8	O95206	1070 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	IGSF6	O95976	241 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TPM1	P09493	284 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TMEM253	P0C7T8	217 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NUDT1	P36639	197 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	ARL4A	P40617	200 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NXPH1	P58417	271 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	IL9R	Q01113	521 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	MMRN1	Q13201	1228 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TC2N	Q8N9U0	490 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	FAM71B	Q8TC56	605 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SLC32A1	Q9H598	525 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		21.16	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TLR4	O00206	839 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	MUSK	O15146	869 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	AP1G1	O43747	822 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PIGN	O95427	931 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CNGA4	Q8IV77	575 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	CCDC42	Q96M95	316 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996	WASF3	Q9UPY6	502 aa		21.15	■□□□□ 0.98
CS-222	ENST00000550996		A0A1B0GTQ1	180 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	AREL1	O15033	823 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	RAD51B	O15315	384 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	PEX11B	O96011	259 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TIMP2	P16035	220 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	ITIH2	P19823	946 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	GJC1	P36383	396 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	CCT8	P50990	548 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	CDH6	P55285	790 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	LZTR1	Q8N653	840 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	SP110	Q9HB58	689 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		21.14	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TMEM131	Q92545	1883 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	AKAP13	Q12802	2813 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	PCDHGA12	O60330	932 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	PALM	O75781	387 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	ZNF75D	P51815	510 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	CLDN2	P57739	230 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	IL10RB	Q08334	325 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	DPYSL3	Q14195	570 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	IQCH	Q86VS3	1027 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	GDF3	Q9NR23	364 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	DKK3	Q9UBP4	350 aa		21.13	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	IGLON5	A6NGN9	336 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	MAN1A1	P33908	653 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	KRT81	Q14533	505 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	STAT4	Q14765	748 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	RAB7B	Q96AH8	199 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		21.12	■□□□□ 0.97
CS-222	ENST00000550996	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	21.12	■□□□□ 0.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms