RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 FRMPD3Q5JV73 1810 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CLRN2A0PK11 232 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CAPN8A6NHC0 703 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RASA4BC9J798 803 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM232C9JQI7 657 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 K7ENM7 598 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 AGPSO00116 658 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PDHXO00330 501 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 DSCR3O14972 297 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RASA4O43374 803 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RASSF9O75901 435 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 APEHP13798 732 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RPS2P15880 293 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CREB1P16220 341 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CD9P21926 228 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 HPDP32754 393 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RWDD2BP57060 319 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 DEUP1Q05D60 604 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 FHL3Q13643 280 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 POSTNQ15063 836 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SEC23BQ15437 767 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 NPY5RQ15761 445 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CNGA3Q16281 694 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 RILPL1Q5EBL4 403 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 ANO1Q5XXA6 986 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 GALNT17Q6IS24 598 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SHC4Q6S5L8 630 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SRLQ86TD4 932 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 LURAP1LQ8IV03 231 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 DCLK2Q8N568 766 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SPATA18Q8TC71 538 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF398Q8TD17 642 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 USP6NLQ92738 828 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SPSB4Q96A44 273 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 JAKMIP2Q96AA8 810 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 HMCESQ96FZ2 354 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 BICD1Q96G01 975 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 C8orf76Q96K31 380 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 TSGA13Q96PP4 275 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 FAM118BQ9BPY3 351 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 MXD3Q9BW11 206 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 AP1M1Q9BXS5 423 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 STK31Q9BXU1 1019 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 FANCFQ9NPI8 374 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SEPT10Q9P0V9 454 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 MGAT4CQ9UBM8 478 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CTNNA3Q9UI47 895 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 L1RE1Q9UN81 338 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 COG5Q9UP83 839 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 C2CD2Q9Y426 696 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 SPTBN2O15020 2390 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.22□□□□□ -1.89
ATXN3-211ENST00000511362 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 COL4A6Q14031 1691 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM64A6NGJ6 449 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM64BA6NI03 449 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 A6NNZ2 444 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ERVV-1B6SEH8 477 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 DCXO43602 365 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TMCC2O75069 709 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 B3GALNT1O75752 331 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 APBB3O95704 486 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CYP1A2P05177 515 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 BRAFP15056 766 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 EPHA3P29320 983 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SERPINB3P29508 390 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 HSPA4P34932 840 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TIRAPP58753 221 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC74AQ0VAA2 488 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PPP2R5CQ13362 524 aa3.21□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 DLGAP5Q15398 846 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms