RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 AVPR1AP37288 418 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PNPLA4P41247 253 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DCTN1Q14203 1278 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZNF585BQ52M93 769 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HORMAD2Q8N7B1 307 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SLC35F5Q8WV83 523 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 Q9N2J8 555 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RALGAPBQ86X10 1494 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 E7EVH7 732 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 H0Y3Z8 333 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ASAP2O43150 1006 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SLC28A2O43868 658 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CHN1P15882 459 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CST5P28325 142 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SELENOVP59797 346 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB16Q05516 673 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 LTBQ06643 244 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 LIN54Q6MZP7 749 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RRAGAQ7L523 313 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TMC8Q8IU68 726 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GALNT15Q8N3T1 639 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 KDM1BQ8NB78 822 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HDAC7Q8WUI4 952 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PHF21BQ96EK2 531 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 STK26Q9P289 416 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 KLQ9UEF7 1012 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CDH22Q9UJ99 828 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZNF112Q9UJU3 913 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 KCND3Q9UK17 655 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SUFUQ9UMX1 484 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TULP4Q9NRJ4 1543 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 ATP7BP35670 1465 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 EYA2O00167 538 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 RGS14O43566 566 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 LIASO43766 372 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 METTL18O95568 372 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 YWHAQP27348 245 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 GPS2Q13227 327 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 PDCLQ13371 301 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 HLFQ16534 295 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 DUSP6Q16828 381 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 SYT13Q7L8C5 426 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 TMEM163Q8TC26 289 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 NCSTNQ92542 709 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 NEUROG1Q92886 237 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 SDCCAG3Q96C92 435 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 CDT1Q9H211 546 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 KLHL31Q9H511 634 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 CD93Q9NPY3 652 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 FBXO40Q9UH90 709 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 OSGIN2Q9Y236 505 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 ITSN1Q15811 1721 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 ADGRB1O14514 1584 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 GLI3P10071 1580 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 C4orf47A7E2U8 309 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 HBP1O60381 514 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 KRT38O76015 456 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 GLUD1P00367 558 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 GLUD2P49448 558 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 PCYT1AP49585 367 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 PNLIPRP1P54315 467 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 CDH12P55289 794 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 TMPRSS3P57727 454 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 KRTAP10-9P60411 292 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-241ENST00000496183 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms